RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 BEND5Q7L4P6 421 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 VSIG10LQ86VR7 867 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TTC5Q8N0Z6 440 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 DTX3Q8N9I9 347 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC30A5Q8TAD4 765 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SSH3Q8TE77 659 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 IQCDQ96DY2 449 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CYFIP2Q96F07 1278 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC120Q96HB5 630 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SNX22Q96L94 193 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 OSBPL6Q9BZF3 934 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 DPH1Q9BZG8 443 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF32Q9H0A6 362 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 USP44Q9H0E7 712 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 LDAHQ9H6V9 325 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SMURF2Q9HAU4 748 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SERHLQ9NQF3 203 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 RASSF1Q9NS23 344 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CLIC5Q9NZA1 410 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CHMP5Q9NZZ3 219 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 STK17AQ9UEE5 414 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 DNAI1Q9UI46 699 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CTNND2Q9UQB3 1225 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SALL3Q9BXA9 1300 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TJP1Q07157 1748 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ITGB4P16144 1822 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM43BA6NCK2 446 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 AQP12BA6NM10 295 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 NUDT19A8MXV4 375 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 F2RL2O00254 374 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM38O00635 465 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 IRAK2O43187 625 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TOM1O60784 492 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PRAMEF4O60810 478 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 COBLO75128 1261 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 POLBP06746 335 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 GAAP10253 952 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 DDCP20711 480 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CAPN3P20807 821 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MCCP23508 829 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CNTFP26441 200 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 GLRBP48167 497 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PER3P56645 1201 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SOX8P57073 446 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 NKX3-2P78367 333 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 NEXNQ0ZGT2 675 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 NR1I3Q14994 352 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TOMM20Q15388 145 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MAN2A1Q16706 1144 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 EMC10Q5UCC4 262 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 GRAMD4Q6IC98 578 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CNKSR3Q6P9H4 555 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF790Q6PG37 636 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ETV3LQ6ZN32 361 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 AMIGO3Q86WK7 504 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MICU3Q86XE3 530 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ERC1Q8IUD2 1116 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TMTC1Q8IUR5 882 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 COLGALT2Q8IYK4 626 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PQLC1Q8N2U9 271 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM26EQ8N5C1 309 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 FANCBQ8NB91 859 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PIK3C3Q8NEB9 887 aa4.75□□□□□ -1.65
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CAPNS1-210ENST00000590211 OR6B3Q8NGW1 331 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CYP2W1Q8TAV3 490 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ASB12Q8WXK4 309 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 KIF1BPQ96EK5 621 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM167BQ9BTA0 163 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 C1orf43Q9BWL3 253 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC26A6Q9BXS9 759 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 BCO1Q9HAY6 547 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 DLL4Q9NR61 685 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TM7SF3Q9NS93 570 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.75□□□□□ -1.65
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