RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HADHQ16836 314 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PGM2Q96G03 612 aa22.53■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IVDP26440 423 aa22.52■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GABRB2P47870 512 aa22.52■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPP2R2AP63151 447 aa22.52■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC29A2Q14542 456 aa22.52■■□□□ 1.2
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STILQ15468 1287 aa22.52■■□□□ 1.2
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TWNKQ96RR1 684 aa22.52■■□□□ 1.2
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 F2P00734 622 aa22.51■■□□□ 1.19
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.51■■□□□ 1.19
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAP2K5Q13163 448 aa22.51■■□□□ 1.19
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KIZQ2M2Z5 673 aa22.51■■□□□ 1.19
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BCAS4Q8TDM0 211 aa22.51■■□□□ 1.19
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TLCD1Q96CP7 247 aa22.51■■□□□ 1.19
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYTH4Q9UIA0 394 aa22.51■■□□□ 1.19
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EFR3BQ9Y2G0 817 aa22.51■■□□□ 1.19
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.5■■□□□ 1.19
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NDC80O14777 642 aa22.5■■□□□ 1.19
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LIASO43766 372 aa22.5■■□□□ 1.19
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LSP1P33241 339 aa22.5■■□□□ 1.19
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ITGA8P53708 1063 aa22.5■■□□□ 1.19
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KRT10P13645 584 aa22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDKN2BP42772 138 aa22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPD2P43304 727 aa22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BEST2Q8NFU1 509 aa22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 JOSD2Q8TAC2 188 aa22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SNX27Q96L92 541 aa22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CPA4Q9UI42 421 aa22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AGTP01019 485 aa22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KLRC2P26717 231 aa22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
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