RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-211ENST00000559850 ADSSL1Q8N142 457 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 OR6B3Q8NGW1 331 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 SHKBP1Q8TBC3 707 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 SPPL2BQ8TCT7 592 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 PBXIP1Q96AQ6 731 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 SYT15Q9BQS2 421 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 SDCBP2Q9H190 292 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 DPEP3Q9H4B8 488 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 CRTAC1Q9NQ79 661 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 GREB1Q4ZG55 1949 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 LRRN2O75325 713 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 KRT13P13646 458 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 PIK3CAP42336 1068 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 LHX1P48742 406 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 TUFMP49411 452 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 EPHA5P54756 1037 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 DDR2Q16832 855 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 EDRF1Q3B7T1 1238 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 ZACNQ401N2 412 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 STXBP5Q5T5C0 1151 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 DPH6Q7L8W6 267 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 MYLPFQ96A32 169 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 SNX25Q9H3E2 840 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 DUSP12Q9UNI6 340 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF197O14709 1029 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 CETN3O15182 167 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 MAPK13O15264 365 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 STAU1O95793 577 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 HLA-DRAP01903 254 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 PCSK1P29120 753 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 ATICP31939 592 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 AP3M2P53677 418 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 CYP27A1Q02318 531 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 ORC1Q13415 861 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF667Q5HYK9 610 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 MDH1BQ5I0G3 518 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 FAM78AQ5JUQ0 283 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 IER5LQ5T953 404 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 TANGO2Q6ICL3 276 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 SCN4BQ8IWT1 228 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 TAS1R2Q8TE23 839 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 PSMG2Q969U7 264 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 TSG101Q99816 390 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 HSFX1Q9UBD0 423 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 CDH9Q9ULB4 789 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 CA14Q9ULX7 337 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 CTNND2Q9UQB3 1225 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 TACC1O75410 805 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 FCARP24071 287 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 GABRR2P28476 465 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 VCPP55072 806 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 STX17P56962 302 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 CYP4F8P98187 520 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 MORC3Q14149 939 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 VEPH1Q14D04 833 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 COBLL1Q53SF7 1204 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 FAM171BQ6P995 826 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 GAREM2Q75VX8 874 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 SPATA18Q8TC71 538 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 ATXN3LQ9H3M9 355 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 FBXL21Q9UKT6 434 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 NCANO14594 1321 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 A8MXQ7 604 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 IKBKBO14920 756 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 EPB41P11171 864 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 SRFP11831 508 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 BDNFP23560 247 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 CCNE1P24864 410 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 VIPR2P41587 438 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 GPC5P78333 572 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 SMARCB1Q12824 385 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 GRM2Q14416 872 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 TAF12Q16514 161 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 MTSS1LQ765P7 747 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 ITIH5Q86UX2 942 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 SIX5Q8N196 739 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 NELFBQ8WX92 580 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 NXPE3Q969Y0 559 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 PCED1BQ96HM7 432 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 VRTNQ9H8Y1 702 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 IL21Q9HBE4 155 aa15.85■□□□□ 0.13
RABGGTA-211ENST00000559850 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms