RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	RUNX3	Q13761	415 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	GAB3	Q8WWW8	586 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	AXIN1	O15169	862 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	TADA3	O75528	432 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	PPP1R37	O75864	691 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	EGF	P01133	1207 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	ARSA	P15289	507 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	ABCD1	P33897	745 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	AVPR1A	P37288	418 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	KCNA1	Q09470	495 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	SMARCB1	Q12824	385 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC142	Q17RM4	750 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	SV2C	Q496J9	727 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	TXNDC8	Q6A555	127 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	USP49	Q70CQ1	688 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	KBTBD6	Q86V97	674 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	SFR1	Q86XK3	245 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM84A	Q96KN4	292 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF40	O75150	1001 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	EPN2	O95208	641 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	RAP1GAP	P47736	663 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	BFSP1	Q12934	665 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	PTPA	Q15257	358 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	DYM	Q7RTS9	669 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	EPSTI1	Q96J88	318 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF560	Q96MR9	790 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	STRA6	Q9BX79	667 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	TDP1	Q9NUW8	608 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	L1RE1	Q9UN81	338 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	PI4KA	P42356	2102 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	IL18RAP	O95256	599 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	BMP15	O95972	392 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	ITGB3	P05106	788 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	CYP2F1	P24903	491 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	DDIT3	P35638	169 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	TSPY1	Q01534	308 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	DDR2	Q16832	855 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	MON1A	Q86VX9	555 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	HVCN1	Q96D96	273 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	SAAL1	Q96ER3	474 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	HHIP	Q96QV1	700 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC22A12	Q96S37	553 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	PKMYT1	Q99640	499 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	ZZEF1	O43149	2961 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	AKAP13	Q12802	2813 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	MYH10	P35580	1976 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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