RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 WNT8AQ9H1J5 351 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 SENP2Q9HC62 589 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 ANAPC7Q9UJX3 599 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 PIK3CDO00329 1044 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 MAN2B1O00754 1011 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 SYN3O14994 580 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 SMIM24O75264 130 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 MTA2O94776 668 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 PCDH8O95206 1070 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 IMPG1Q17R60 797 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 FAF2Q96CS3 445 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 EPSTI1Q96J88 318 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 NELL2Q99435 816 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 C11orf70Q9BRQ4 267 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 TTPALQ9BTX7 342 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 BCO2Q9BYV7 579 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 NUF2Q9BZD4 464 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 CDH9Q9ULB4 789 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 SFI1A8K8P3 1242 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 NFKBIEO00221 500 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 MAPK13O15264 365 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF286BP0CG31 522 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 PTPN2P17706 415 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 CES1P23141 567 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF75DP51815 510 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 NCKAP1LP55160 1127 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 ROR1Q01973 937 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 MAGEC3Q8TD91 643 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 UNC45AQ9H3U1 944 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 PRDM10Q9NQV6 1147 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 USP18Q9UMW8 372 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 LSM8O95777 96 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 DNTTP04053 509 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 ELNP15502 786 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 RHOAP61586 193 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 TWF1Q12792 350 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 LRRC49Q8IUZ0 686 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM175Q9BSA9 504 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 MORF4L1Q9UBU8 362 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 SQORQ9Y6N5 450 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 ENC1O14682 589 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 HGSO14964 777 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 HMBSP08397 361 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 SENP1Q9P0U3 644 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 ADGRA2Q96PE1 1338 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 DFFAO00273 331 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 NCAM1P13591 858 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 GPD1P21695 349 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 CCR1P32246 355 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 NDUFA8P51970 172 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 ACLYP53396 1101 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 BEX3Q00994 111 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 TLE2Q04725 743 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 PRKCZQ05513 592 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 HDXQ7Z353 690 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 FAM71BQ8TC56 605 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 CPVLQ9H3G5 476 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 FANCFQ9NPI8 374 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 BUB1O43683 1085 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 PDGFRBP09619 1106 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 TP53BP2Q13625 1128 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 KCNA10Q16322 511 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 KLHL38Q2WGJ6 581 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 ADCK5Q3MIX3 580 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 GRAMD4Q6IC98 578 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 NLRP9Q7RTR0 991 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 KLHL7Q8IXQ5 586 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 RCOR2Q8IZ40 523 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 TCF25Q9BQ70 676 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 PPCSQ9HAB8 311 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 TNFSF13BQ9Y275 285 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 CRYL1Q9Y2S2 319 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 NFAT5O94916 1531 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms