RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 LMAN1P49257 510 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 KYAT1Q16773 422 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 RAB6CQ53S08 254 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 RAPGEF5Q92565 580 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 RAB6CQ9H0N0 254 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 MED7O43513 233 aa22.14■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 IGHA2P01877 340 aa22.14■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 PDGFRBP09619 1106 aa22.14■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 P4HA1P13674 534 aa22.14■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 GPD2P43304 727 aa22.14■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 INHBEP58166 350 aa22.14■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.14■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 UBXN11Q5T124 520 aa22.14■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa22.14■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 CENPHQ9H3R5 247 aa22.14■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.14■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.14■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 ZWILCHQ9H900 591 aa22.14■■□□□ 1.14
PRDM4-205ENST00000550376 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 PRKCZQ05513 592 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 ZBTB6Q15916 424 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 XYLT1Q86Y38 959 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 C3orf20Q8ND61 904 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 HAUS1Q96CS2 278 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 ZFP42Q96MM3 310 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 OSBPL8Q9BZF1 889 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 SPTLC1O15269 473 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 HSPA6P17066 643 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 PSMA2P25787 234 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 MYO1EQ12965 1108 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 PPP1R7Q15435 360 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 CYP1B1Q16678 543 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 ALS2CLQ60I27 953 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 LHX5Q9H2C1 402 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 AOC2O75106 756 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 ELNP15502 786 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 PDCLQ13371 301 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 FAM182AQ5T1J6 154 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC114Q96M63 670 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 FMO2Q99518 471 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 PLVAPQ9BX97 442 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 FAM187AA6NFU0 413 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 CA12O43570 354 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 PSTPIP1O43586 416 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 KRT1P04264 644 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 DMTNQ08495 405 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 TAF5Q15542 800 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 CLUL1Q15846 466 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 LRRC19Q9H756 370 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 IPPQ9Y573 584 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 LMO2P25791 158 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 IL1R2P27930 398 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 KRT17Q04695 432 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 SREBF2Q12772 1141 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 PPP2R5EQ16537 467 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC142Q17RM4 750 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 MREGQ8N565 214 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 SH3GL2Q99962 352 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 GOLGA6CA6NDK9 693 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 PFKMP08237 780 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 VDRP11473 427 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 CNGA2Q16280 664 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PRDM4-205ENST00000550376 FAM228AQ86W67 206 aa22.11■■□□□ 1.13
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