RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 KRT13P13646 458 aa21.42■■□□□ 1.02
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CTDSP2-204ENST00000548823 NAMPTP43490 491 aa21.42■■□□□ 1.02
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CTDSP2-204ENST00000548823 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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CTDSP2-204ENST00000548823 SLC7A3Q8WY07 619 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC42Q96M95 316 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.022e-9■■■■■ 36.3
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CTDSP2-204ENST00000548823 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 DNAI1Q9UI46 699 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 DYNC1I1O14576 645 aa21.4■■□□□ 1.02
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CTDSP2-204ENST00000548823 MAFO75444 373 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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CTDSP2-204ENST00000548823 RETP07949 1114 aa21.4■■□□□ 1.02
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CTDSP2-204ENST00000548823 ARHGAP25P42331 645 aa21.4■■□□□ 1.02
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CTDSP2-204ENST00000548823 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa21.4■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 COLGALT2Q8IYK4 626 aa21.4■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 GPR65Q8IYL9 337 aa21.4■■□□□ 1.02
CTDSP2-204ENST00000548823 CRACR2AQ9BSW2 395 aa21.4■■□□□ 1.02
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CTDSP2-204ENST00000548823 UCHL3P15374 230 aa21.39■■□□□ 1.02
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CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.39■■□□□ 1.02
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CTDSP2-204ENST00000548823 CASQ1P31415 396 aa21.38■■□□□ 1.01
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CTDSP2-204ENST00000548823 SHC2P98077 582 aa21.38■■□□□ 1.01
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CTDSP2-204ENST00000548823 FGF13Q92913 245 aa21.38■■□□□ 1.01
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CTDSP2-204ENST00000548823 GCNT4Q9P109 453 aa21.38■■□□□ 1.01
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CTDSP2-204ENST00000548823 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 PRKCIP41743 596 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 KIF11P52732 1056 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-204ENST00000548823 VAV2P52735 878 aa21.36■■□□□ 1.01
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