RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 PRKG1Q13976 671 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 TAZQ16635 292 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 KYNUQ16719 465 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 EFCAB12Q6NXP0 572 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 LLGL2Q6P1M3 1020 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 BBS12Q6ZW61 710 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CCDC13Q8IYE1 715 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 LRRC71Q8N4P6 559 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SLC35B2Q8TB61 432 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 AFG1LQ8WV93 481 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CKAP2Q8WWK9 683 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 OTUD5Q96G74 571 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 FAM84AQ96KN4 292 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 MAGEB18Q96M61 343 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 NLRP4Q96MN2 994 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 HERPUD2Q9BSE4 406 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ELP3Q9H9T3 547 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 VTA1Q9NP79 307 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ASNSD1Q9NWL6 643 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ITGA11Q9UKX5 1188 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 DNPEPQ9ULA0 475 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 C2CD2Q9Y426 696 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 DOCK5Q9H7D0 1870 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 FAM47DPA6NHR8 397 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 MCF2LO15068 1137 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ALOX15BO15296 676 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ARIH2O95376 493 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 C22orf31O95567 290 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 GH1P01241 217 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 KRT19P08727 400 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SETSIPP0DME0 302 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 TXNP10599 105 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 PCK1P35558 622 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 GABRB2P47870 512 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ARL4CP56559 192 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CDC42EP1Q00587 391 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 IL9RQ01113 521 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 GPS1Q13098 491 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 TFDP2Q14188 446 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 KLHL38Q2WGJ6 581 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 HSDL1Q3SXM5 330 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SEZ6Q53EL9 994 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 C2CD6Q53TS8 623 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 KAZNQ674X7 775 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 DENND1BQ6P3S1 775 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 VSIG1Q86XK7 387 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 PPIL6Q8IXY8 311 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 LRRC34Q8IZ02 419 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ATP11CQ8NB49 1132 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CCT6BQ92526 530 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 FGD4Q96M96 766 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ADPGKQ9BRR6 497 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 RSAD1Q9HA92 442 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 IFT122Q9HBG6 1241 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SAYSD1Q9NPB0 183 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 KCNK9Q9NPC2 374 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 TMEM51Q9NW97 253 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 DERAQ9Y315 318 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 PTPRFP10586 1907 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 UNCXA6NJT0 531 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 RASA4BC9J798 803 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 F8VP50 259 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SGK1O00141 431 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 RASA4O43374 803 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SNX3O60493 162 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CILPO75339 1184 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SPAG6O75602 509 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 STAG3L1P0CL83 205 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CXCL8P10145 99 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP10.28□□□□□ -0.762e-9■■□□□ 12.8
CS-205ENST00000546891 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SCTRP47872 440 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 RAD23BP54727 409 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 RBP5P82980 135 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 OGDHQ02218 1023 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 XRCC4Q13426 336 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 TMEM132DQ14C87 1099 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 LLGL1Q15334 1064 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 HIF1AQ16665 826 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 PTPN20Q4JDL3 420 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ZNF394Q53GI3 561 aa10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms