RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CXCL8P10145 99 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 GHRP10912 638 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CYP2B6P20813 491 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ALDH3A1P30838 453 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 OSTNP61366 133 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 GNGT1P63211 74 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 USP4Q13107 963 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 TRPC3Q13507 836 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CCL14Q16627 93 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 KYAT1Q16773 422 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ACAD10Q6JQN1 1059 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 C11orf63Q6NUN7 778 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 TMEM270Q6UE05 265 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 TMEM192Q8IY95 271 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 PHC3Q8NDX5 983 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 HES6Q96HZ4 224 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CPB2Q96IY4 423 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 RUFY1Q96T51 708 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 SELENOOQ9BVL4 669 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 SETD4Q9NVD3 440 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 EHD2Q9NZN4 543 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ATXN10Q9UBB4 475 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 GJD2Q9UKL4 321 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 GTF3C4Q9UKN8 822 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 COG5Q9UP83 839 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 KAT6AQ92794 2004 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 NRCAMQ92823 1304 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 TSPAN1O60635 241 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 MTA2O94776 668 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CALCAP01258 141 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 IGHA2P01877 340 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CYP1A2P05177 515 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 STAG3L1P0CL83 205 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CCDC166P0CW27 439 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 UNGP13051 313 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 GNA15P30679 374 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CPT1AP50416 773 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ZNF132P52740 706 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 MYL6P60660 151 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 VSNL1P62760 191 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 PHEXP78562 749 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 HTRA3P83110 453 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CDC42EP1Q00587 391 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CRHR2Q13324 411 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 MFSD10Q14728 455 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 PTPROQ16827 1216 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CCDC121Q6ZUS5 278 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 UBR7Q8N806 425 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ACTRT1Q8TDG2 376 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 PPP2R3CQ969Q6 453 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ZNF653Q96CK0 615 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 AP5M1Q9H0R1 490 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 EPN3Q9H201 632 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CENPHQ9H3R5 247 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 UVRAGQ9P2Y5 699 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 Q9Y3F1 56 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 LRRD1A4D1F6 860 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 LACTBL1A8MY62 500 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 HAS3O00219 553 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 SMIM24O75264 130 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 TMCC1O94876 653 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ATP6V1G2O95670 118 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 NFICP08651 508 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 TM4SF4P48230 202 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 PSEN2P49810 448 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 INHBCP55103 352 aa8.22□□□□□ -1.09
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