RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 GAS7O60861 476 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 FZD7O75084 574 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 PDHBP11177 359 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 CSF2RBP32927 897 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 GLRBP48167 497 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 ZNF75DP51815 510 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 CACNB3P54284 484 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 AMPD3Q01432 767 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 TTC38Q5R3I4 469 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 PLA2G4DQ86XP0 818 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 AJUBAQ96IF1 538 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 BARHL2Q9NY43 387 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 SERPINB13Q9UIV8 391 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 LTBP1Q14766 1721 aa6.11□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 MYO3BQ8WXR4 1341 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 MYH7P12883 1935 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 PPIP5K2O43314 1243 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 FOXS1O43638 330 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 BMP15O95972 392 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 HLA-DOAP06340 250 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 CALML3P27482 149 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 TRAPPC10P48553 1259 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 EPHA5P54756 1037 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 IRF9Q00978 393 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 PFKPQ01813 784 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 PNOCQ13519 176 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 CCDC93Q567U6 631 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 FIGNQ5HY92 759 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 ISM2Q6H9L7 571 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 TATDN1Q6P1N9 297 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 SARM1Q6SZW1 724 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 STPG3Q8N7X2 389 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 CNNM3Q8NE01 707 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 EPSTI1Q96J88 318 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 CCDC17Q96LX7 622 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 PIGSQ96S52 555 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 PSMD1Q99460 953 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 BPIFA3Q9BQP9 254 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 BOCQ9BWV1 1114 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 ZMYND12Q9H0C1 365 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 VPS33BQ9H267 617 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 VAT1LQ9HCJ6 419 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 LRRC37AA6NMS7 1700 aa6.1□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 SMCO2A6NFE2 343 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 OVOL3O00110 214 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 PSMD14O00487 310 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 ENTPD3O75355 529 aa6.09□□□□□ -1.43
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TRDN-205ENST00000546248 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 IL2P60568 153 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 DSG1Q02413 1049 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 ZNF543Q08ER8 600 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 TCP10Q12799 353 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 KLF10Q13118 480 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 DHCR24Q15392 516 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 CD276Q5ZPR3 534 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 GALNT17Q6IS24 598 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.09□□□□□ -1.43
TRDN-205ENST00000546248 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.09□□□□□ -1.43
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