RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 CMTM8Q8IZV2 173 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 PDCL2Q8N4E4 241 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 HVCN1Q96D96 273 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF560Q96MR9 790 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 EBF3Q9H4W6 596 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 PCIF1Q9H4Z3 704 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 STK17AQ9UEE5 414 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 L1RE1Q9UN81 338 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 EXTL3O43909 919 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 WEE1P30291 646 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 PXNP49023 591 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 NLRP12P59046 1061 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 PLCB2Q00722 1185 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 BFSP1Q12934 665 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 DDR2Q16832 855 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 LONP2Q86WA8 852 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 BRSK2Q8IWQ3 736 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 C1orf127Q8N9H9 656 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 TTC16Q8NEE8 873 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 RIN3Q8TB24 985 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 HPS4Q9NQG7 708 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 EXOC7Q9UPT5 735 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 RETP07949 1114 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 CYP2F1P24903 491 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 AVPR1AP37288 418 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 TSPY1Q01534 308 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 RESTQ13127 1097 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 OSTM1Q86WC4 334 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 SYCP3Q8IZU3 236 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 CBWD1Q9BRT8 395 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 KRT19P08727 400 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 ARSAP15289 507 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 GAP43P17677 238 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 SMARCB1Q12824 385 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 CEP68Q76N32 757 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 CHFRQ96EP1 664 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM83CQ9BQN1 747 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 SEMA4GQ9NTN9 838 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 SEL1LQ9UBV2 794 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A087X0B3 334 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 SDHBP21912 280 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 CUL4AQ13619 759 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 RUNX3Q13761 415 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 FSTL4Q6MZW2 842 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 NT5DC4Q86YG4 428 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 PDE11AQ9HCR9 933 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 GTF3C4Q9UKN8 822 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 GDF9O60383 454 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 HUS1O60921 280 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 TXLNAP40222 546 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 PNPLA4P41247 253 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 RTKNQ9BST9 563 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 TRPC7Q9HCX4 862 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 TDP1Q9NUW8 608 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 SNX9Q9Y5X1 595 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRJ-205ENST00000527952 CSH1P0DML2 217 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 CSH2P0DML3 217 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 SYT1P21579 422 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 STAT6P42226 847 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC6Q16204 474 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 PDILTQ8N807 584 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 CXorf38Q8TB03 319 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 CYP2S1Q96SQ9 504 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 ACBD6Q9BR61 282 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 MTMR12Q9C0I1 747 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 PANK4Q9NVE7 773 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 SIX4Q9UIU6 781 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 TADA3O75528 432 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 EGFP01133 1207 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 GARTP22102 1010 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 MYL7Q01449 175 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 PRR23CQ6ZRP0 262 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 MON1AQ86VX9 555 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 WDR5BQ86VZ2 330 aa25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms