RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527109.5

RPS2-205, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 1 (best)

Gene RPS2, Length 1,030 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-205	ENST00000527109	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	CHFR	Q96EP1	664 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	ZNF560	Q96MR9	790 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	USP28	Q96RU2	1077 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	GKN1	Q9NS71	199 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	TXNDC8	Q6A555	127 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	HPS4	Q9NQG7	708 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	PDC	P20941	246 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	CYP2F1	P24903	491 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	SMARCB1	Q12824	385 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	BFSP1	Q12934	665 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	DDR2	Q16832	855 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	PKMYT1	Q99640	499 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	SIX4	Q9UIU6	781 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	RAB23	Q9ULC3	237 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	TADA3	O75528	432 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	TXLNA	P40222	546 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	STAT6	P42226	847 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	PLCB2	Q00722	1185 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	TSPY1	Q01534	308 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	EML5	Q05BV3	1969 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	HPS3	Q969F9	1004 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	EBF3	Q9H4W6	596 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	PANK4	Q9NVE7	773 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		27.54	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	PTPRJ	Q12913	1337 aa		27.53	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	GART	P22102	1010 aa		27.53	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	PNPLA4	P41247	253 aa		27.53	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	LMNB2	Q03252	620 aa		27.53	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	PDILT	Q8N807	584 aa		27.53	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		27.53	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		27.53	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	MTMR6	Q9Y217	621 aa		27.53	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	EXTL3	O43909	919 aa		27.52	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	ARSA	P15289	507 aa		27.52	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	AVPR1A	P37288	418 aa		27.52	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	SLC39A14	Q15043	492 aa		27.52	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		27.52	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	LONP2	Q86WA8	852 aa		27.52	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	ACBD6	Q9BR61	282 aa		27.52	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		27.52	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
RPS2-205	ENST00000527109	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		27.51	■■□□□ 1.99
RPS2-205	ENST00000527109	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		27.51	■■□□□ 1.99
RPS2-205	ENST00000527109	HUS1	O60921	280 aa		27.51	■■□□□ 1.99
RPS2-205	ENST00000527109	KRT19	P08727	400 aa		27.51	■■□□□ 1.99
RPS2-205	ENST00000527109	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
RPS2-205	ENST00000527109	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		27.51	■■□□□ 1.99
RPS2-205	ENST00000527109	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		27.51	■■□□□ 1.99
RPS2-205	ENST00000527109	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
RPS2-205	ENST00000527109	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
RPS2-205	ENST00000527109	TDP1	Q9NUW8	608 aa		27.51	■■□□□ 1.99
RPS2-205	ENST00000527109	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		27.51	■■□□□ 1.99
RPS2-205	ENST00000527109	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
RPS2-205	ENST00000527109	PTPRD	P23468	1912 aa		27.51	■■□□□ 1.99
RPS2-205	ENST00000527109	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		27.5	■■□□□ 1.99
RPS2-205	ENST00000527109	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
RPS2-205	ENST00000527109	RET	P07949	1114 aa		27.5	■■□□□ 1.99
RPS2-205	ENST00000527109	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
RPS2-205	ENST00000527109	ARHGAP8	P85298	464 aa		27.5	■■□□□ 1.99
RPS2-205	ENST00000527109	RUNX3	Q13761	415 aa		27.5	■■□□□ 1.99

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms