RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 GSDMDP57764 484 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 PLPP4Q5VZY2 271 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF280DQ6N043 979 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKS3Q6ZW76 656 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAAF5Q86Y56 855 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 CRYBG2Q8N1P7 616 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF606Q8WXB4 792 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 PIK3R5Q8WYR1 880 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 PANX2Q96RD6 677 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 CDH9Q9ULB4 789 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 GBF1Q92538 1859 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 HIDE1A8MVS5 230 aa24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 CXCL14O95715 111 aa24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM163BP0C2L3 166 aa24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 PCSK1P29120 753 aa24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 ADORA2BP29275 332 aa24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 PDE6CP51160 858 aa24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 MEA1Q16626 185 aa24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC39A12Q504Y0 691 aa24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 PALB2Q86YC2 1186 aa24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC8AQ8IWT6 810 aa24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC2A14Q8TDB8 520 aa24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 CLSTN3Q9BQT9 956 aa24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 SZT2Q5T011 3432 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 SOWAHDA6NJG2 315 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 TBC1D4O60343 1298 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 SERPING1P05155 500 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 PAEPP09466 180 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 OR1D2P34982 312 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP27A1Q02318 531 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 MTF1Q14872 753 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 PTPN14Q15678 1187 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM139Q8IV31 216 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 TTC39CQ8N584 583 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 OLIG1Q8TAK6 271 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 CYFIP2Q96F07 1278 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 PCED1BQ96HM7 432 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 TNIP3Q96KP6 325 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 PKMYT1Q99640 499 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 VWA8A3KMH1 1905 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 RB1P06400 928 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 CTSAP10619 480 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 UBA3Q8TBC4 463 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 B3GNT5Q9BYG0 378 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 MTRRQ9UBK8 725 aa24.16■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 CARNS1A5YM72 827 aa24.15■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 H3BNC9 293 aa24.15■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 TSPY1Q01534 308 aa24.15■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 SGO2Q562F6 1265 aa24.15■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 MYLPFQ96A32 169 aa24.15■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHB18PQ96TA0 734 aa24.15■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 TLR9Q9NR96 1032 aa24.15■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 H7C4K7 107 aa24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 O00370 1275 aa24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 LILRB3O75022 631 aa24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 VDRP11473 427 aa24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 CPB1P15086 417 aa24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 PRKCIP41743 596 aa24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 FMO1Q01740 532 aa24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 DENND1BQ6P3S1 775 aa24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM171BQ6P995 826 aa24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 PAQR9Q6ZVX9 377 aa24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 FUKQ8N0W3 1084 aa24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 ATAD1Q8NBU5 361 aa24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 AGPAT1Q99943 283 aa24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 SYT11Q9BT88 431 aa24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNF1Q9H3M0 494 aa24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1-208ENST00000524325 TEX28O15482 410 aa24.14■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 CNPP09543 421 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 CACNA2D1P54289 1103 aa24.14■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 BPIFB4P59827 614 aa24.14■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa24.14■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 TTC9BQ8N6N2 239 aa24.14■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 SPATA18Q8TC71 538 aa24.14■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 SAMD11Q96NU1 681 aa24.14■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 MED10Q9BTT4 135 aa24.14■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa24.14■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 TSPAN16Q9UKR8 245 aa24.14■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 LZTS1Q9Y250 596 aa24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms