RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518858.1

CLVS1-204, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 2,980 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-204ENST00000518858 RNF169Q8NCN4 708 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 GSTCDQ8NEC7 633 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 DENND1AQ8TEH3 1009 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 ATG4AQ8WYN0 398 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 FAM118BQ9BPY3 351 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 HEPHQ9BQS7 1158 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 NACAP1Q9BZK3 213 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 TRABDQ9H4I3 376 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 ARHGEF4Q9NR80 690 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 SLC7A8Q9UHI5 535 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 LZTS1Q9Y250 596 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 NEU2Q9Y3R4 380 aa8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CLVS1-204ENST00000518858 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TRMUO75648 421 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 STAMBPO95630 424 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 RARBP10826 455 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 MUTP22033 750 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 NOP14P78316 857 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 PLCB3Q01970 1234 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 NR1H3Q13133 447 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 USH1GQ495M9 461 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 CCDC62Q6P9F0 684 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 IYDQ6PHW0 289 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 NUP93Q8N1F7 819 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 SNX27Q96L92 541 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 NUP85Q9BW27 656 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 PLVAPQ9BX97 442 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 PCDHA4Q9UN74 947 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TMED5Q9Y3A6 229 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TELO2Q9Y4R8 837 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TRIM17Q9Y577 477 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 A0A1B0GTW7 788 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 POTEMA6NI47 508 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 A8MXQ7 604 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 E9PBE3 544 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 OR52Z1P0C646 297 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ALAS1P13196 640 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ADRA1DP25100 572 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 CTNNA2P26232 953 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 PON1P27169 355 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ASPHQ12797 758 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ITGA9Q13797 1035 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 PPP2R5EQ16537 467 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 FYB2Q5VWT5 728 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 Q6ZNX1 250 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TRABD2AQ86V40 505 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 BBS5Q8N3I7 341 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 AGBL3Q8NEM8 1001 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 RFFLQ8WZ73 363 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 IRGQQ8WZA9 623 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 MAML1Q92585 1016 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 GJA10Q969M2 543 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 CALML4Q96GE6 196 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 BTBD6Q96KE9 485 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TCHPQ9BT92 498 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 LRRC27Q9C0I9 530 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 NENFQ9UMX5 172 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TRPM7Q96QT4 1865 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 MEI4A8MW99 385 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 GOLGA8RI6L899 631 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 EGFRP00533 1210 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 RCAN1P53805 252 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 PFKPQ01813 784 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 MESDQ14696 234 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ADGRA1Q86SQ6 560 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ULK2Q8IYT8 1036 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ARHGAP24Q8N264 748 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 PNMA5Q96PV4 448 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 GMLQ99445 158 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 CENPOQ9BU64 300 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms