RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 ZBTB6Q15916 424 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PTPN20Q4JDL3 420 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SGO2Q562F6 1265 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 DCUN1D2Q6PH85 259 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 NIPA2Q8N8Q9 360 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 DNAJB3Q8WWF6 145 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PKNOX2Q96KN3 472 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 MCEEQ96PE7 176 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM31Q9BZY9 425 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CYTH4Q9UIA0 394 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 AKR1A1P14550 325 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 FLT3P36888 993 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 HSD17B3P37058 310 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PURAQ00577 322 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 BEX3Q00994 111 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 OGDHQ02218 1023 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 MYO1EQ12965 1108 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 MTMR3Q13615 1198 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SNX17Q15036 470 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CNGA2Q16280 664 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SPDYCQ5MJ68 293 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CYP4A22Q5TCH4 519 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC38Q5VT99 294 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 ALKAL1Q6UXT8 129 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 FMO2Q99518 471 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 HERPUD2Q9BSE4 406 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CXCL16Q9H2A7 254 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GRHL1Q9NZI5 618 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CNTN3Q9P232 1028 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA1257Q9ULG3 409 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 USTQ9Y2C2 406 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 C17orf102A2RUQ5 167 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SIGLEC16A6NMB1 481 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 MICAL2O94851 1124 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 KRT14P02533 472 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GPD2P43304 727 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 RPL21P46778 160 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GABRB2P47870 512 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 KCNJ1P48048 391 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 ORC1Q13415 861 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 ZDHHC24Q6UX98 284 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 LRIG3Q6UXM1 1119 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC50Q8IVM0 306 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 NME8Q8N427 588 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CPXM1Q96SM3 734 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TXLNGYQ9BZA5 131 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 OSBPL8Q9BZF1 889 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 HOMER3Q9NSC5 361 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PARP2Q9UGN5 583 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PLAAQ9Y263 795 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SNX24Q9Y343 169 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GOLGA6CA6NDK9 693 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 F8VP50 259 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 M0QYV0 167 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PPFIA2O75334 1257 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 RECQL4O94761 1208 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 ECEL1O95672 775 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GOLGA6DP0CG33 693 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 RALAP11233 206 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GNAT1P11488 350 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 KRT3P12035 628 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CYBAP13498 195 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 NDST1P52848 882 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 LLGL1Q15334 1064 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TTMPQ5BVD1 217 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 XYLT1Q86Y38 959 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 RCOR2Q8IZ40 523 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC52Q8N7C0 313 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 BEST2Q8NFU1 509 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf54Q8WWF1 131 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 FAM129AQ9BZQ8 928 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 DCLK3Q9C098 648 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
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