RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498713.1

ANKRD28-214, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 1,091 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-214ENST00000498713 ABCD1P33897 745 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 CYP2J2P51589 502 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 ACLYP53396 1101 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 TFDP1Q14186 410 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 FAM187BQ17R55 369 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 VWA3BQ502W6 1294 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 SESTD1Q86VW0 696 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 VSTM4Q8IW00 320 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 NME8Q8N427 588 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 C7orf31Q8N865 590 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 SPC24Q8NBT2 197 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 GOLGA5Q8TBA6 731 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 DNAJB3Q8WWF6 145 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 ISL2Q96A47 359 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 NLRP4Q96MN2 994 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 CBWD1Q9BRT8 395 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 PTPRHQ9HD43 1115 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 EXOC7Q9UPT5 735 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 AKT3Q9Y243 479 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 CITO14578 2027 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 A0A0B4J269 797 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 LGALS16A8MUM7 142 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 ACKR2O00590 384 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 ABLIM1O14639 778 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 MAPK13O15264 365 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 GARTP22102 1010 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 GPC3P51654 580 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 CDC42EP1Q00587 391 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 UBXN1Q04323 297 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 MBTD1Q05BQ5 628 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 STRN3Q13033 797 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 ITGA7Q13683 1181 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 MAN2A1Q16706 1144 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 C1orf220Q5T0J3 134 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 SLFN12LQ6IEE8 588 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 ARMCX5Q6P1M9 558 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 RNF180Q86T96 592 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 DRC7Q8IY82 874 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 XXYLT1Q8NBI6 393 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 ARRDC4Q8NCT1 418 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 POMGNT1Q8WZA1 660 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 ERGIC2Q96RQ1 377 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 C2orf40Q9H1Z8 148 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 NDST4Q9H3R1 872 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 A0A1W2PQC6 194 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 GOLGA8IPA6NC78 632 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 GOLGA8JA6NMD2 632 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 RFXAPO00287 272 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 B4GALT5O43286 388 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 EXOC3O60645 756 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 CABYRO75952 493 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 CHRNA1P02708 482 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 PRKCBP05771 671 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 ADRB2P07550 413 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 EPB41P11171 864 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 CCL5P13501 91 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 PROZP22891 400 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 KLK7P49862 253 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 LIG4P49917 911 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 CDK7P50613 346 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 TMEM62Q0P6H9 643 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 MAPK6Q16659 721 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 KIZQ2M2Z5 673 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 ZPBP2Q6X784 338 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-214ENST00000498713 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms