RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 KCNC2Q96PR1 638 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 GPR87Q9BY21 358 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 RGL1Q9NZL6 768 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 AQP7P3A6NL99 342 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 GPR42O15529 346 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 KCNQ3O43525 872 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 MAN2A2P49641 1150 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 LOXL3P58215 753 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 KRT17Q04695 432 aa9.08□□□□□ -0.96
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PTPRC-212ENST00000491302 HS1BP3Q53T59 392 aa9.08□□□□□ -0.96
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PTPRC-212ENST00000491302 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
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PTPRC-212ENST00000491302 LEFTY2O00292 366 aa9.07□□□□□ -0.96
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PTPRC-212ENST00000491302 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
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PTPRC-212ENST00000491302 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 PXNP49023 591 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 FOXO1Q12778 655 aa9.07□□□□□ -0.96
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PTPRC-212ENST00000491302 ATG16L2Q8NAA4 619 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 GLIS1Q8NBF1 620 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 C18orf8Q96DM3 657 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP9.07□□□□□ -0.96
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PTPRC-212ENST00000491302 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 RNF181Q9P0P0 153 aa9.07□□□□□ -0.96
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PTPRC-212ENST00000491302 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa9.07□□□□□ -0.96
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PTPRC-212ENST00000491302 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.07□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GTW7 788 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 LGALS16A8MUM7 142 aa9.06□□□□□ -0.96
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PTPRC-212ENST00000491302 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
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PTPRC-212ENST00000491302 H7C4K7 107 aa9.05□□□□□ -0.96
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PTPRC-212ENST00000491302 LIMS2Q7Z4I7 341 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 CLNKQ7Z7G1 428 aa9.05□□□□□ -0.96
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PTPRC-212ENST00000491302 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa9.05□□□□□ -0.96
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PTPRC-212ENST00000491302 TOR1BO14657 336 aa9.04□□□□□ -0.96
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PTPRC-212ENST00000491302 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
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PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa9.04□□□□□ -0.96
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