RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 FAM160B1Q5W0V3 765 aa5.6□□□□□ -1.51
SSB-211ENST00000490914 CEP85Q6P2H3 762 aa5.6□□□□□ -1.51
SSB-211ENST00000490914 USP45Q70EL2 814 aa5.6□□□□□ -1.51
SSB-211ENST00000490914 CPA6Q8N4T0 437 aa5.6□□□□□ -1.51
SSB-211ENST00000490914 SLC46A1Q96NT5 459 aa5.6□□□□□ -1.51
SSB-211ENST00000490914 TTYH3Q9C0H2 523 aa5.6□□□□□ -1.51
SSB-211ENST00000490914 HESX1Q9UBX0 185 aa5.6□□□□□ -1.51
SSB-211ENST00000490914 ZNF804BA4D1E1 1349 aa5.59□□□□□ -1.51
SSB-211ENST00000490914 TISP43B9A030 160 aa5.59□□□□□ -1.51
SSB-211ENST00000490914 DTNBO60941 627 aa5.59□□□□□ -1.51
SSB-211ENST00000490914 IGSF3O75054 1194 aa5.59□□□□□ -1.51
SSB-211ENST00000490914 FAM163BP0C2L3 166 aa5.59□□□□□ -1.51
SSB-211ENST00000490914 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
SSB-211ENST00000490914 MPGP29372 298 aa5.59□□□□□ -1.51
SSB-211ENST00000490914 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
SSB-211ENST00000490914 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
SSB-211ENST00000490914 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
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SSB-211ENST00000490914 DTX2Q86UW9 622 aa5.59□□□□□ -1.51
SSB-211ENST00000490914 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
SSB-211ENST00000490914 DLL3Q9NYJ7 618 aa5.59□□□□□ -1.51
SSB-211ENST00000490914 SERTAD3Q9UJW9 196 aa5.59□□□□□ -1.51
SSB-211ENST00000490914 PROB1E7EW31 1015 aa5.58□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 SMIM22K7EJ46 135 aa5.58□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 DNAJB5O75953 348 aa5.58□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 JTBO76095 146 aa5.58□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 POU2F2P09086 479 aa5.58□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 HDCP19113 662 aa5.58□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 EPHB2P29323 1055 aa5.58□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 TREML2Q5T2D2 321 aa5.58□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa5.58□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.58□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 FANCBQ8NB91 859 aa5.58□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 TBC1D5Q92609 795 aa5.58□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 SH2D3AQ9BRG2 576 aa5.58□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 PNPOQ9NVS9 261 aa5.58□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5.58□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 CADPSQ9ULU8 1353 aa5.57□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 KELP23276 732 aa5.57□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 CYP2C18P33260 490 aa5.57□□□□□ -1.52
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SSB-211ENST00000490914 PLS1Q14651 629 aa5.57□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 SLC44A4Q53GD3 710 aa5.57□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa5.57□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 ICE2Q659A1 982 aa5.57□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 C11orf87Q6NUJ2 197 aa5.57□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 ANKRD16Q6P6B7 361 aa5.57□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 ZNF366Q8N895 744 aa5.57□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 MACROD1Q9BQ69 325 aa5.57□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 IL33O95760 270 aa5.56□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 CYP2D6P10635 497 aa5.56□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 LILRA4P59901 499 aa5.56□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 ETFDHQ16134 617 aa5.56□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 PGS1Q32NB8 556 aa5.56□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.56□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 LONRF3Q496Y0 759 aa5.56□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 CEP78Q5JTW2 689 aa5.56□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 TMEM240Q5SV17 173 aa5.56□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 ARHGAP40Q5TG30 622 aa5.56□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 NEK8Q86SG6 692 aa5.56□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5.56□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 ATG4AQ8WYN0 398 aa5.56□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 NELL2Q99435 816 aa5.56□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 SPEF1Q9Y4P9 236 aa5.56□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 H3BUI4 141 aa5.55□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 QSOX1O00391 747 aa5.55□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 TLR5O60602 858 aa5.55□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 UNC5CO95185 931 aa5.55□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 FESP07332 822 aa5.55□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 ENGP17813 658 aa5.55□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 LOXL3P58215 753 aa5.55□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 TUBA4AP68366 448 aa5.55□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 CYP4F2P78329 520 aa5.55□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 PCID2Q5JVF3 399 aa5.55□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 FAM167AQ96KS9 214 aa5.55□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 SEMA4CQ9C0C4 833 aa5.55□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 DUSP22Q9NRW4 184 aa5.55□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 BTBD3Q9Y2F9 522 aa5.55□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 CTGFP29279 349 aa5.54□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 SOX8P57073 446 aa5.54□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 KRTAP10-9P60411 292 aa5.54□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 EMC10Q5UCC4 262 aa5.54□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.54□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 LAYNQ6UX15 382 aa5.54□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 NAPRTQ6XQN6 538 aa5.54□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
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