RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 MYCP01106 439 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 CD247P20963 164 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 CXCR2P25025 360 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 LONP1P36776 959 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 ETFBP38117 255 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 LIFRP42702 1097 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 ALDH3B2P48448 385 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZBTB16Q05516 673 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 RASGRF1Q13972 1273 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRABD2AQ86V40 505 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 NINJ2Q9NZG7 142 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLAIN2Q9P270 581 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 CAPN14A8MX76 684 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 PODXLO00592 558 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDH16O75309 829 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 ABCB4P21439 1286 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 GCAP28676 217 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 ETV3P41162 512 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 EPS15P42566 896 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRC63Q05C16 580 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF276Q8N554 614 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 C4orf32Q8N8J7 132 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 LGR6Q9HBX8 967 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 DTNAQ9Y4J8 743 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 AP4B1Q9Y6B7 739 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 FMN2Q9NZ56 1722 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACEP12821 1306 aa7.22□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 TOM1O60784 492 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 CSPG5O95196 566 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 P4HA1P13674 534 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF23P17027 643 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 BMPR1AP36894 532 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARL4CP56559 192 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 KDSRQ06136 332 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 C6orf52Q5T4I8 152 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 RHBDF2Q6PJF5 856 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRC55Q6ZSA7 311 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 LSMEM2Q8N112 164 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 DTX3Q8N9I9 347 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 HIPK4Q8NE63 616 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 GSDMBQ8TAX9 411 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 GIPC2Q8TF65 315 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 TANKQ92844 425 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 CALN1Q9BXU9 219 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 WNT8AQ9H1J5 351 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 MARCH7Q9H992 704 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 TBC1D14Q9P2M4 693 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 PI4KBQ9UBF8 816 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 NENFQ9UMX5 172 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 NID2Q14112 1375 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCM1Q15154 2024 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA2D3-210ENST00000490478 H3BNX3 289 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATE1O95260 518 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 POLR2MP0CAP2 368 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAG1P15918 1043 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 GABRB3P28472 473 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHRNA3P32297 505 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 IFNA8P32881 189 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 APLP1P51693 650 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 BMXP51813 675 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDKL1Q00532 357 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 OASLQ15646 514 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms