RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488684.5

POLR2F-211, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR2F, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-211ENST00000488684 DMWDQ09019 674 aa24.1■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 ALCAMQ13740 583 aa24.1■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 LRRC32Q14392 662 aa24.1■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 PON2Q15165 354 aa24.1■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 SDHAF4Q5VUM1 108 aa24.1■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 OSTM1Q86WC4 334 aa24.1■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 GLIS3Q8NEA6 775 aa24.1■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 ACBD6Q9BR61 282 aa24.1■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 SIX4Q9UIU6 781 aa24.1■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 CCL26Q9Y258 94 aa24.1■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 HOXC13P31276 330 aa24.09■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 PLCB2Q00722 1185 aa24.09■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 BFSP1Q12934 665 aa24.09■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 LPAL2Q16609 132 aa24.09■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC142Q17RM4 750 aa24.09■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 LRRC52Q8N7C0 313 aa24.09■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 MAB21L3Q8N8X9 362 aa24.09■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 PKMYT1Q99640 499 aa24.09■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 GKN1Q9NS71 199 aa24.09■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 OBSL1O75147 1896 aa24.09■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 K7ESF4 209 aa24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 HCRTO43612 131 aa24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 HUS1O60921 280 aa24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 CYP2F1P24903 491 aa24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 NASPP49321 788 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 CCINQ13939 588 aa24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 DDR2Q16832 855 aa24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 DGKKQ5KSL6 1271 aa24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 TXNDC8Q6A555 127 aa24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 HPS3Q969F9 1004 aa24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 FAM83CQ9BQN1 747 aa24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 MTMR12Q9C0I1 747 aa24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 PARD6AQ9NPB6 346 aa24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 GDAP2Q9NXN4 497 aa24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 GTF3C4Q9UKN8 822 aa24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 ITGA11Q9UKX5 1188 aa24.08■■□□□ 1.45
POLR2F-211ENST00000488684 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa24.07■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 STX6O43752 255 aa24.07■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 KRT19P08727 400 aa24.07■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 FNTBP49356 437 aa24.07■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa24.07■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 TMEM86AQ8N2M4 240 aa24.07■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 GPD1LQ8N335 351 aa24.07■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 LINC00301Q8NCQ3 95 aa24.07■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 RIN3Q8TB24 985 aa24.07■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 TMEM206Q9H813 350 aa24.07■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 ZMYM5Q9UJ78 669 aa24.07■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 SNX9Q9Y5X1 595 aa24.07■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 PTPRJQ12913 1337 aa24.07■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 ATG2BQ96BY7 2078 aa24.06■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 GABRDO14764 452 aa24.06■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 HRO43593 1189 aa24.06■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 CSH1P0DML2 217 aa24.06■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 CSH2P0DML3 217 aa24.06■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 HOXD13P35453 343 aa24.06■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 RBP5P82980 135 aa24.06■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 E2F4Q16254 413 aa24.06■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC65Q8IXS2 484 aa24.06■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 OR5B17Q8NGF7 314 aa24.06■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 CHFRQ96EP1 664 aa24.06■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 HPS4Q9NQG7 708 aa24.06■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 INTS13Q9NVM9 706 aa24.06■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 SDK1Q7Z5N4 2213 aa24.06■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 TADA3O75528 432 aa24.05■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.441e-6■□□□□ 10.8
POLR2F-211ENST00000488684 AVPR1AP37288 418 aa24.05■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 MYL7Q01449 175 aa24.05■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 STK38Q15208 465 aa24.05■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 SOWAHAQ2M3V2 549 aa24.05■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 TRIM68Q6AZZ1 485 aa24.05■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 MON1AQ86VX9 555 aa24.05■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 TOP6BLQ8N6T0 577 aa24.05■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 ABCB6Q9NP58 842 aa24.05■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 TDP1Q9NUW8 608 aa24.05■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.05■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 TMEM191BP0C7N4 346 aa24.04■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
POLR2F-211ENST00000488684 RUNX3Q13761 415 aa24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms