RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 CYP26C1Q6V0L0 522 aa35.12■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 HSFX1Q9UBD0 423 aa35.12■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa35.12■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 DENND4AQ7Z401 1863 aa35.12■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 DOCK6Q96HP0 2047 aa35.11■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 CCL16O15467 120 aa35.11■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 ATAT1Q5SQI0 421 aa35.11■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 AOPEPQ8N6M6 819 aa35.11■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 SPPL2BQ8TCT7 592 aa35.11■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 RIPOR3Q96MK2 946 aa35.11■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 YIPF1Q9Y548 306 aa35.11■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa35.11■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 PTPRDP23468 1912 aa35.11■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 POU2F2P09086 479 aa35.1■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 MTHFRP42898 656 aa35.1■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 INCA1Q0VD86 236 aa35.1■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 TJAP1Q5JTD0 557 aa35.1■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 MIIPQ5JXC2 388 aa35.1■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 ARID3AQ99856 593 aa35.1■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 HMGXB4Q9UGU5 601 aa35.1■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 LRG1P02750 347 aa35.09■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 LRMPQ12912 555 aa35.09■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 EHBP1Q8NDI1 1231 aa35.09■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 NECTIN4Q96NY8 510 aa35.09■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 NDST1P52848 882 aa35.08■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 TWF1Q12792 350 aa35.08■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 VWA3BQ502W6 1294 aa35.08■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 UNC93AQ86WB7 457 aa35.08■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa35.08■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa35.08■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 NT5C1BQ96P26 610 aa35.08■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 LPIN3Q9BQK8 851 aa35.08■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 HSD3B7Q9H2F3 369 aa35.08■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 POMKQ9H5K3 350 aa35.08■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 PIDD1Q9HB75 910 aa35.08■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 GCNT4Q9P109 453 aa35.08■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 XYLBO75191 536 aa35.07■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 CD58P19256 250 aa35.07■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 ZNF165P49910 485 aa35.07■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 CUL2Q13617 745 aa35.07■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 MDH1BQ5I0G3 518 aa35.07■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 MYLPFQ96A32 169 aa35.07■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 NDST4Q9H3R1 872 aa35.07■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 ABCB6Q9NP58 842 aa35.07■■■■□ 3.21
CHKB-210ENST00000484266 SOAT2O75908 522 aa35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 MGAT5BQ3V5L5 792 aa35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 PCED1BQ96HM7 432 aa35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 TWNKQ96RR1 684 aa35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 NOTCH4Q99466 2003 aa35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 CILPO75339 1184 aa35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 ZNF18P17022 549 aa35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 TUFMP49411 452 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 ORC1Q13415 861 aa35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 CFAP221Q4G0U5 840 aa35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 C4orf50Q6ZRC1 276 aa35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 WHAMMQ8TF30 809 aa35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 TNIP3Q96KP6 325 aa35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 CRACR2AQ9BSW2 395 aa35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 CISHQ9NSE2 258 aa35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 TAB2Q9NYJ8 693 aa35.06■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 KRT31Q15323 416 aa35.05■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 GBP6Q6ZN66 633 aa35.05■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 ACOT1Q86TX2 421 aa35.05■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 CRYBG2Q8N1P7 616 aa35.05■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 CEP72Q9P209 647 aa35.05■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 CYP2F1P24903 491 aa35.04■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 ALDH1A3P47895 512 aa35.04■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 PLD1Q13393 1074 aa35.04■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa35.04■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 ATF6P18850 670 aa35.03■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 CYP27A1Q02318 531 aa35.03■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 IQCB1Q15051 598 aa35.03■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 TRIM65Q6PJ69 517 aa35.03■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 ARHGEF19Q8IW93 802 aa35.03■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 PPM1KQ8N3J5 372 aa35.03■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 TTC39CQ8N584 583 aa35.03■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 NT5C1AQ9BXI3 368 aa35.03■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 CLUHO75153 1309 aa35.02■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 SMTNL1A8MU46 457 aa35.02■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 SLC9A1P19634 815 aa35.02■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 EXOC3L4Q17RC7 722 aa35.02■■■■□ 3.2
CHKB-210ENST00000484266 UBR7Q8N806 425 aa35.02■■■■□ 3.2
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