RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479398.5

PKP4-209, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-209ENST00000479398 ATF6P18850 670 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 TMC8Q8IU68 726 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 SYT15Q9BQS2 421 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 ABCB6Q9NP58 842 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 GJA1P17302 382 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 CYP2F1P24903 491 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 STIM1Q13586 685 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 VEPH1Q14D04 833 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 ZNF699Q32M78 642 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 GIPC2Q8TF65 315 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 SRFP11831 508 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 CCNE1P24864 410 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 PPP1R2P41236 205 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 LRRC63Q05C16 580 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 PPP3CAQ08209 521 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 MORC3Q14149 939 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
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PKP4-209ENST00000479398 TAF4BQ92750 862 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 GPR88Q9GZN0 384 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 NME7Q9Y5B8 376 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP4-209ENST00000479398 A0A1W2PRU2 124 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 PSMA7O14818 248 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 FGF19O95750 216 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 HLA-DRAP01903 254 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 TRIM49P0CI25 452 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 TRIM49CP0CI26 452 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 BMP6P22004 513 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 GTF2H1P32780 548 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 GCLMP48507 274 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 CDH8P55286 799 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 TEAD2Q15562 447 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 TAF12Q16514 161 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 CCDC142Q17RM4 750 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 GAREM2Q75VX8 874 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 FBXL6Q8N531 539 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 GPR152Q8TDT2 470 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
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PKP4-209ENST00000479398 WNT16Q9UBV4 365 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 A8MXQ7 604 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 BIN1O00499 593 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 ECI2O75521 394 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 CFHP08603 1231 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 GPR15P49685 360 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 DDR2Q16832 855 aa22.13■■□□□ 1.13
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PKP4-209ENST00000479398 TANGO2Q6ICL3 276 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 ELSPBP1Q96BH3 223 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 ASB16Q96NS5 453 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 KXD1Q9BQD3 176 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 CLSTN1O94985 981 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 P4HA1P13674 534 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 GABRR2P28476 465 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 PIK3CAP42336 1068 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 MAGEA11P43364 429 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 GPC5P78333 572 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 CAMK4Q16566 473 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 SMARCD2Q92925 531 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 IL21Q9HBE4 155 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 FBXL21Q9UKT6 434 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 CSH1P0DML2 217 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP4-209ENST00000479398 CSH2P0DML3 217 aa22.11■■□□□ 1.13
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