RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 SPA17Q15506 151 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 ELF2Q15723 593 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CCDC40Q4G0X9 1142 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 ARSHQ5FYA8 562 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 GPR149Q86SP6 731 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 RSAD2Q8WXG1 361 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 RSPH1Q8WYR4 309 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 TSC1Q92574 1164 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 NECTIN4Q96NY8 510 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 TCHPQ9BT92 498 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CHST7Q9NS84 486 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 ANO9A1A5B4 782 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CARNS1A5YM72 827 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 PDXKO00764 312 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CCL16O15467 120 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 NTHL1P78549 312 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 SKOR1P84550 965 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 SIGLEC14Q08ET2 396 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 PSMD5Q16401 504 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 NFIL3Q16649 462 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 KIAA1328Q86T90 577 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CYP4X1Q8N118 509 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 PRSS33Q8NF86 280 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 NEK11Q8NG66 645 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 ASIC4Q96FT7 647 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CCDC42Q96M95 316 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 DRC1Q96MC2 740 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 WDR24Q96S15 920 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 MYADMQ96S97 322 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 TTPALQ9BTX7 342 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CARD6Q9BX69 1037 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 PIDD1Q9HB75 910 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 CEP72Q9P209 647 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa6.71□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.33
MITF-215ENST00000478490 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa6.71□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 SPTLC1O15269 473 aa6.71□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 ST8SIA5O15466 376 aa6.71□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 PLS3P13797 630 aa6.71□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 MCM3P25205 808 aa6.71□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 ANXA13P27216 316 aa6.71□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 ARHGAP25P42331 645 aa6.71□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 VAV2P52735 878 aa6.71□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 ARPP19P56211 112 aa6.71□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 KIF5AQ12840 1032 aa6.71□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 STRN3Q13033 797 aa6.71□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 ADAM9Q13443 819 aa6.71□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 ALCAMQ13740 583 aa6.71□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
MITF-215ENST00000478490 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.71□□□□□ -1.34
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