RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 NNTQ13423 1086 aa6.84□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 TUSC3Q13454 348 aa6.84□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa6.84□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.84□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.84□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 FAF2Q96CS3 445 aa6.84□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.84□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.84□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.84□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.84□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.84□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 AMFRQ9UKV5 643 aa6.84□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 CDH9Q9ULB4 789 aa6.84□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 HHLA1C9JL84 531 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 SYN3O14994 580 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 HOXA2O43364 376 aa6.83□□□□□ -1.32
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PRKCI-202ENST00000476635 OAZ2O95190 189 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 CFHP08603 1231 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 FGFR4P22455 802 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 TNNC1P63316 161 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 BRD3Q15059 726 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 SGO2Q562F6 1265 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
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PRKCI-202ENST00000476635 IRGQQ8WZA9 623 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 ACBD6Q9BR61 282 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 NUP85Q9BW27 656 aa6.83□□□□□ -1.32
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PRKCI-202ENST00000476635 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 MIOSQ9NXC5 875 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 STK39Q9UEW8 545 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 L1RE1Q9UN81 338 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.83□□□□□ -1.32
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PRKCI-202ENST00000476635 PPEF2O14830 753 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 THP07101 528 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 FGFR1P11362 822 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 MCM3P25205 808 aa6.83□□□□□ -1.32
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PRKCI-202ENST00000476635 CHMP4BP1P59074 171 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 PTPN20Q4JDL3 420 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 OLFML1Q6UWY5 402 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.83□□□□□ -1.32
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PRKCI-202ENST00000476635 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 MMS19Q96T76 1030 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 HMGXB4Q9UGU5 601 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 ALG6Q9Y672 507 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.83□□□□□ -1.32
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PRKCI-202ENST00000476635 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 GABBR2O75899 941 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 THPOP40225 353 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 AIF1P55008 147 aa6.83□□□□□ -1.32
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PRKCI-202ENST00000476635 CLLU1OSQ5K130 101 aa6.83□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.83□□□□□ -1.32
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PRKCI-202ENST00000476635 EXD1Q8NHP7 514 aa6.83□□□□□ -1.32
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PRKCI-202ENST00000476635 CCDC151A5D8V7 595 aa6.82□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 PODXLO00592 558 aa6.82□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 THAP12O43422 761 aa6.82□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 CTAGE8P0CG41 777 aa6.82□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 CD52P31358 61 aa6.82□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 BCAT1P54687 386 aa6.82□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC142Q17RM4 750 aa6.82□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.82□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.82□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 CTAGE6Q86UF2 777 aa6.82□□□□□ -1.32
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