RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 TCEAL3Q969E4 200 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 DNAJC19Q96DA6 116 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 CYP2S1Q96SQ9 504 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 ZHX3Q9H4I2 956 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 ASB7Q9H672 318 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 DERAQ9Y315 318 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 C2CD2Q9Y426 696 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 CLIC4Q9Y696 253 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 IGF2RP11717 2491 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-206ENST00000474188 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 OBSL1O75147 1896 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 KPNA7A9QM74 516 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 RNF40O75150 1001 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 ATP2C2O75185 946 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 EPN2O95208 641 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 SDHBP21912 280 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 PMLP29590 882 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 CNR2P34972 360 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 GJA4P35212 333 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 DYMQ7RTS9 669 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 ITIH5Q86UX2 942 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 MON1AQ86VX9 555 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 CD302Q8IX05 232 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 FAM200AQ8TCP9 573 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 GAB3Q8WWW8 586 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 SAAL1Q96ER3 474 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 AK8Q96MA6 479 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 CLIC6Q96NY7 704 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 HHIPQ96QV1 700 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 TSPAN18Q96SJ8 248 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 LINC00597Q9H2U6 94 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 TBC1D7Q9P0N9 293 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 GCNT4Q9P109 453 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 KCNG1Q9UIX4 513 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 RAB23Q9ULC3 237 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 CACNA1GO43497 2377 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 ZZEF1O43149 2961 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 SPAG17Q6Q759 2223 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 ABCA7Q8IZY2 2146 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 GOLGA8IPA6NC78 632 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 GOLGA8JA6NMD2 632 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 H0YCG3 227 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 DPYSL4O14531 572 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 XPOTO43592 962 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 NOL4O94818 638 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 CDC25CP30307 473 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 DDIT3P35638 169 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 UBA7P41226 1012 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 PLCB2Q00722 1185 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 ZNF77Q15935 545 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 KYAT1Q16773 422 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 PLK5Q496M5 336 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 SYNPOQ8N3V7 929 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 CBWD1Q9BRT8 395 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 GTF3C4Q9UKN8 822 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 AGAP1Q9UPQ3 857 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 WNT6Q9Y6F9 365 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 C2orf78A6NCI8 922 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 GABRDO14764 452 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 SLC26A4O43511 780 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 RPP40O75818 363 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 ITGB3P05106 788 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 ZNF806P0C7X5 589 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 LMO2P25791 158 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 HOXD13P35453 343 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 USP46P62068 366 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 PPP2R5DQ14738 602 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 RABEP1Q15276 862 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 C1orf228Q6PIY5 440 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 CEP68Q76N32 757 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 LIMS2Q7Z4I7 341 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 BRSK2Q8IWQ3 736 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 SPPL2BQ8TCT7 592 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 HPS3Q969F9 1004 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 CALML4Q96GE6 196 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 FAM213AQ9BRX8 229 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 ECT2Q9H8V3 914 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 TDP1Q9NUW8 608 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 TMEM30AQ9NV96 361 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 INVSQ9Y283 1065 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms