RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	TOR3A	Q9H497	397 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	SYBU	Q9NX95	663 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	RAD54B	Q9Y620	910 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	MAST3	O60307	1309 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	MYO1C	O00159	1063 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	MYO1F	O00160	1098 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	UNC5C	O95185	931 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	GC	P02774	474 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	SLPI	P03973	132 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	GRP	P07492	148 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	SRGN	P10124	158 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	NPR1	P16066	1061 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	NPTX2	P47972	431 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	NDUFV1	P49821	464 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	MC2R	Q01718	297 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454		Q6ZPA2	131 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	SSH3	Q8TE77	659 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	GJA10	Q969M2	543 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454		Q96MF0	132 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	HESX1	Q9UBX0	185 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454		A0A0B4J269	797 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	PROM1	O43490	865 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	PEX1	O43933	1283 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	VPS4B	O75351	444 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	DNAJB5	O75953	348 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	ESRRB	O95718	433 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	CYP2C9	P11712	490 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	BRAF	P15056	766 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	KRT4	P19013	534 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	VIPR2	P41587	438 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	PIK3CB	P42338	1070 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	HTR3A	P46098	478 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	HMGA2	P52926	109 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	FMO1	Q01740	532 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	TUBB3	Q13509	450 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	MORC3	Q14149	939 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	CNGA2	Q16280	664 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	LONRF1	Q17RB8	773 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	LONRF3	Q496Y0	759 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	LAYN	Q6UX15	382 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454		Q6ZNX1	250 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	SRL	Q86TD4	932 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	DPP9	Q86TI2	863 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	MORC1	Q86VD1	984 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC138	Q96M89	665 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	MRI	Q9BWK5	157 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	TMX2	Q9Y320	296 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	COL4A3	Q01955	1670 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454		A0A087X1B8	175 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454		F5H697	171 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	TBX3	O15119	743 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	ORC4	O43929	436 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D4	O60343	1298 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	TM4SF4	P48230	202 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	ARFIP2	P53365	341 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	SEC24C	P53992	1094 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	WNT3	P56703	355 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLK1-208	ENST00000464454	LOXL3	P58215	753 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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