RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 LILRA2Q8N149 483 aa5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 USP38Q8NB14 1042 aa5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP2A3Q93084 1043 aa5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF125Q96EQ8 232 aa5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 RADILQ96JH8 1075 aa5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R9BQ96SB3 815 aa5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM209Q96SK2 561 aa5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 SLF1Q9BQI6 1058 aa5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 PACSIN1Q9BY11 444 aa5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 PDCL3Q9H2J4 239 aa5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 PRDM13Q9H4Q3 707 aa5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 ACAD9Q9H845 621 aa5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 CHODLQ9H9P2 273 aa5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBTB26Q9HCK0 441 aa5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 G6PC2Q9NQR9 355 aa5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 ZFP69BQ9UJL9 534 aa5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 DERAQ9Y315 318 aa5.24□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 E7EVH7 732 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 MASP2O00187 686 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDH17O14917 1159 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 CCP110O43303 1012 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 TSPAN3O60637 253 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC43A1O75387 559 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 IGLV1-40P01703 118 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 ACADMP11310 421 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 FOSL1P15407 271 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 GYPEP15421 78 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 TPH1P17752 444 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 OAS2P29728 719 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 ATICP31939 592 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 ALDH1A3P47895 512 aa5.23□□□□□ -1.57
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CBX1P4-201ENST00000439415 DLG4P78352 724 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGEF7Q14155 803 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 RILPL1Q5EBL4 403 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC30A6Q6NXT4 461 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 ZDHHC24Q6UX98 284 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 CD300LDQ6UXZ3 194 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 ZSCAN30Q86W11 494 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 PDSS2Q86YH6 399 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 RASGRP3Q8IV61 690 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 AOPEPQ8N6M6 819 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 STPG3Q8N7X2 389 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC191Q8NCU4 936 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 CPT1CQ8TCG5 803 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 CREB3L4Q8TEY5 395 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa5.23□□□□□ -1.57
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CBX1P4-201ENST00000439415 C3orf49Q96BT1 292 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 EPS8L2Q9H6S3 715 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 MRGBPQ9NV56 204 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 ZSCAN32Q9NX65 697 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 PIM2Q9P1W9 311 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 XPR1Q9UBH6 696 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 DAPP1Q9UN19 280 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa5.23□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 NUDT19A8MXV4 375 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA0355O15063 1070 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 MTSS1O43312 755 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT38O76015 456 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 HPXP02790 462 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 MPOP05164 745 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 APOA4P06727 396 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 ANXA6P08133 673 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 SRGAP2BP0DMP2 458 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 PORP16435 677 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 ABCD3P28288 659 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC5A2P31639 672 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 ADCY8P40145 1251 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNC1P48547 511 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 MAPKAPK2P49137 400 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 MCM2P49736 904 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 DUSP2Q05923 314 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 WTAPQ15007 396 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR68Q15743 365 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 INSCQ1MX18 579 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM60Q495X7 471 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 TIGD5Q53EQ6 642 aa5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
CBX1P4-201ENST00000439415 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa5.22□□□□□ -1.57
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