RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 DOCK5Q9H7D0 1870 aa17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 KLF11O14901 512 aa17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC22O60826 627 aa17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 PEX11AO75192 247 aa17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 RPSAP08865 295 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 MARK3P27448 753 aa17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 ARL2P36404 184 aa17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 NCOA4Q13772 614 aa17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 KRT72Q14CN4 511 aa17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 DCUN1D2Q6PH85 259 aa17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 NLRP9Q7RTR0 991 aa17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 CPXCR1Q8N123 301 aa17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 PYROXD1Q8WU10 500 aa17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 MSTO1Q9BUK6 570 aa17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 NIF3L1Q9GZT8 377 aa17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM39BQ9GZU3 492 aa17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 LHX5Q9H2C1 402 aa17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP17.71■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 33.6
HCLS1-202ENST00000428394 RNF146Q9NTX7 359 aa17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 RABGEF1Q9UJ41 708 aa17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 ZFP69BQ9UJL9 534 aa17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
HCLS1-202ENST00000428394 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 K7ERI5 159 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP17.7■□□□□ 0.425e-6■■□□□ 12.5
HCLS1-202ENST00000428394 ATG7O95352 703 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 ACADSP16219 412 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 ICAM3P32942 547 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 EFNA5P52803 228 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 ACTR2P61160 394 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 TAF11Q15544 211 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 OTOAQ7RTW8 1153 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 EXOC8Q8IYI6 725 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 FAM13CQ8NE31 585 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 PWWP2AQ96N64 755 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 CYTH2Q99418 400 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM55Q9BYV6 548 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 GGT7Q9UJ14 662 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 CLUHO75153 1309 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 PHIPQ8WWQ0 1821 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 VWA5AO00534 786 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 KIF3CO14782 793 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 MED7O43513 233 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 ATP6V1C1P21283 382 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 WDR72Q3MJ13 1102 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 SWSAP1Q6NVH7 229 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 LVRNQ6Q4G3 990 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 CDAN1Q8IWY9 1227 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 PDIK1LQ8N165 341 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 ARHGAP24Q8N264 748 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 NAT8LQ8N9F0 302 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 BANPQ8N9N5 519 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 ASAP3Q8TDY4 903 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 MZB1Q8WU39 189 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 PNPLA8Q9NP80 782 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 STOML1Q9UBI4 398 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 NUB1Q9Y5A7 615 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa17.7■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 FAM170AA1A519 330 aa17.69■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 SGK1O00141 431 aa17.69■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 GAS2O43903 313 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 SPAG7O75391 227 aa17.69■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 GSTA2P09210 222 aa17.69■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 DHRS4L1P0CG22 281 aa17.69■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 TPBGLP0DKB5 382 aa17.69■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 T-ENOLP0DO92 83 aa17.69■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 GLRA2P23416 452 aa17.69■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 SLC1A5Q15758 541 aa17.69■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 DBN1Q16643 649 aa17.69■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 CLNKQ7Z7G1 428 aa17.69■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa17.69■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 C12orf42Q96LP6 360 aa17.69■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 SH2D3AQ9BRG2 576 aa17.69■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 ZNRF3Q9ULT6 936 aa17.69■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 LRRD1A4D1F6 860 aa17.68■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 SIGLEC16A6NMB1 481 aa17.68■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 OATP04181 439 aa17.68■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 KRT4P19013 534 aa17.68■□□□□ 0.42
HCLS1-202ENST00000428394 CHRNA5P30532 468 aa17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.7 ms