RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.521e-8■■■■■ 81.6
FAAP20-209ENST00000428120 NT5C1AQ9BXI3 368 aa24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 FAM204AQ9H8W3 233 aa24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 VDRP11473 427 aa24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 KRT3P12035 628 aa24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 PRKCZQ05513 592 aa24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 PDCLQ13371 301 aa24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 NBPF20Q3BBV1 942 aa24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 IQCKQ8N0W5 287 aa24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-209ENST00000428120 KRT14P02533 472 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 AXLP30530 894 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 GPD2P43304 727 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 RPL21P46778 160 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 CNGA2Q16280 664 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 FAM47CQ5HY64 1035 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 MFSD14CQ5VZR4 134 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 C9orf57Q5W0N0 161 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 XYLT1Q86Y38 959 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC19Q9H756 370 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 HCRTO43612 131 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 CTSHP09668 335 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 HSD17B3P37058 310 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 PLTPP55058 493 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 ACOT1Q86TX2 421 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 TSPAN16Q9UKR8 245 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 IPPQ9Y573 584 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 NME7Q9Y5B8 376 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 HMGCRP04035 888 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 GJA9P57773 515 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 FAM228AQ86W67 206 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 ARRDC4Q8NCT1 418 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 EXD1Q8NHP7 514 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 WNT8BQ93098 351 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 LPIN3Q9BQK8 851 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 OSBPL8Q9BZF1 889 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 FAM49BQ9NUQ9 324 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 KRT10P13645 584 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 PSMA2P25787 234 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 FNTAP49354 379 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 TAP1Q03518 808 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 ADCY2Q08462 1091 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 KAZNQ674X7 775 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 FBXO25Q8TCJ0 367 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 FMO2Q99518 471 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 SIGLEC16A6NMB1 481 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 KRT1P04264 644 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 NME8Q8N427 588 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 ARL8AQ96BM9 186 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 SH3GL2Q99962 352 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 GRHL1Q9NZI5 618 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 PODXLO00592 558 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 ECEL1O95672 775 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 PPP1R7Q15435 360 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 ZDHHC24Q6UX98 284 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 TMC3Q7Z5M5 1100 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 PLAAQ9Y263 795 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 CDY2AQ9Y6F7 541 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 OR6B3Q8NGW1 331 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC45Q96CN5 670 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 SPTLC1O15269 473 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 RGS7P49802 495 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 SOWAHAQ2M3V2 549 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC52Q8N7C0 313 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 OR2W6PQ8NHA6 318 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 DCLK3Q9C098 648 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 DPEP3Q9H4B8 488 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM88BA6NKF7 163 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 TULP2O00295 520 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 RARBP10826 455 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 KRT17Q04695 432 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 SMTNL2Q2TAL5 461 aa24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms