RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395422.3

CHCHD2-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHCHD2, Length 901 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2-201ENST00000395422 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.59□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.59□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 KLK13Q9UKR3 277 aa14.59□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 DSPP15924 2871 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa14.58□□□□□ -0.07
CHCHD2-201ENST00000395422 CITO14578 2027 aa14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 ANO9A1A5B4 782 aa14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 SOBPA7XYQ1 873 aa14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 TAF4O00268 1085 aa14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.088e-17■□□□□ 9.4
CHCHD2-201ENST00000395422 AMPD2Q01433 879 aa14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 MTF1Q14872 753 aa14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF77Q15935 545 aa14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 ANO7Q6IWH7 933 aa14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 MON1AQ86VX9 555 aa14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 RASSF3Q86WH2 238 aa14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 ACDQ96AP0 544 aa14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 FAM212AQ96EL1 285 aa14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 SLC22A12Q96S37 553 aa14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.58□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 SMTNP53814 917 aa14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 NCKAP1LP55160 1127 aa14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 EML3Q32P44 896 aa14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 KRT79Q5XKE5 535 aa14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 WSCD1Q658N2 575 aa14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 CPA6Q8N4T0 437 aa14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 TTC16Q8NEE8 873 aa14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 MDGA1Q8NFP4 955 aa14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 USP33Q8TEY7 942 aa14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 OSCP1Q8WVF1 389 aa14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 PIGKQ92643 395 aa14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 BICD1Q96G01 975 aa14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 C8orf76Q96K31 380 aa14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 CYP2S1Q96SQ9 504 aa14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 TIPINQ9BVW5 301 aa14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.57□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 K7EQS6 105 aa14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 CYB561D2O14569 222 aa14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 OGTO15294 1046 aa14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 MAPK8P45983 427 aa14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 TRAPPC10P48553 1259 aa14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 SLC12A3P55017 1021 aa14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 SEC13P55735 322 aa14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 ANAPC15P60006 121 aa14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 USP4Q13107 963 aa14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 SLC39A4Q6P5W5 647 aa14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 FRMD1Q8N878 549 aa14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 PNMA5Q96PV4 448 aa14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 TMEM74BQ9NUR3 256 aa14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 MSRB2Q9Y3D2 182 aa14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 STK24Q9Y6E0 443 aa14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 TSC2P49815 1807 aa14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 NBEAQ8NFP9 2946 aa14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 ABCA7Q8IZY2 2146 aa14.56□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 CAPNS1P04632 268 aa14.55□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 PTGER3P43115 390 aa14.55□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 LIG4P49917 911 aa14.55□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.55□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 SMARCB1Q12824 385 aa14.55□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 GAB4Q2WGN9 574 aa14.55□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 C2orf27AQ580R0 203 aa14.55□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.55□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 ARSHQ5FYA8 562 aa14.55□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.55□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 PIP4P1Q86T03 277 aa14.55□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 C11orf74Q86VG3 221 aa14.55□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.55□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 OLIG1Q8TAK6 271 aa14.55□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 RLN3Q8WXF3 142 aa14.55□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 KCNN1Q92952 543 aa14.55□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 FNBP1Q96RU3 617 aa14.55□□□□□ -0.08
CHCHD2-201ENST00000395422 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms