RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395038.6

SOS1-201, Transcript of SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SOS1, Length 4,123 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1-201ENST00000395038 DNAJC24Q6P3W2 148 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 ZNF276Q8N554 614 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 CHST13Q8NET6 341 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 SPOCK2Q92563 424 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 CYLDQ9NQC7 956 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 ZNF148Q9UQR1 794 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 SPAG7O75391 227 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 KRT16P08779 473 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 SSR1P43307 286 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 MSS51Q4VC12 460 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 ANKRD22Q5VYY1 191 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 TMEM35BQ8NCS4 154 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 CCDC77Q9BR77 488 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 EBF2Q9HAK2 575 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 HOXC10Q9NYD6 342 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.63□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 E7ESA3 106 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 LRCH4O75427 683 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 WEE2P0C1S8 567 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 SLC1A5Q15758 541 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 ZBTB33Q86T24 672 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 CXorf38Q8TB03 319 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 TCP11Q8WWU5 503 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 CPT1BQ92523 772 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 HAUS1Q96CS2 278 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 LHX5Q9H2C1 402 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 TRABDQ9H4I3 376 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 BTBD7Q9P203 1132 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 FETUBQ9UGM5 382 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 A0A1W2PPM1 405 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 SIGLEC16A6NMB1 481 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 OGTO15294 1046 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 STAT5BP51692 787 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 EFNA5P52803 228 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 PDK4Q16654 411 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 ZNF394Q53GI3 561 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 LBX2Q6XYB7 198 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 RPAINQ86UA6 219 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 BCO2Q9BYV7 579 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 LRRD1A4D1F6 860 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 A8MUI8 341 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 LGR5O75473 907 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 SLC8A1P32418 973 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 IL9RQ01113 521 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 ACCSLQ4AC99 568 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 TREML2Q5T2D2 321 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 BBS12Q6ZW61 710 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 KIF2BQ8N4N8 673 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 FGD4Q96M96 766 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 SDCBP2Q9H190 292 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 C10orf88Q9H8K7 445 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 NRBP2Q9NSY0 501 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 SIX4Q9UIU6 781 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 POLIQ9UNA4 740 aa6.62□□□□□ -1.35
SOS1-201ENST00000395038 CHKBQ9Y259 395 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms