RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391171.1

RNU1-101P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 101, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-101P, Length 127 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-101P-201ENST00000391171 KCNK16Q96T55 309 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 CGRRF1Q99675 332 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 FAM118BQ9BPY3 351 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 HEPHQ9BQS7 1158 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 TEX12Q9BXU0 123 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 ITPAQ9BY32 194 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 GPR63Q9BZJ6 419 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 NACAP1Q9BZK3 213 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 CD244Q9BZW8 370 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 KLHL25Q9H0H3 589 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 C19orf44Q9H6X5 657 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 MMRN2Q9H8L6 949 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 KCNK13Q9HB14 408 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 PFDN4Q9NQP4 134 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 INTS13Q9NVM9 706 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 NINJ2Q9NZG7 142 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 HSPBP1Q9NZL4 362 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 CHMP5Q9NZZ3 219 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 HMG20BQ9P0W2 317 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 RABGEF1Q9UJ41 708 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 ANAPC5Q9UJX4 755 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 ASB3Q9Y575 518 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 CAPN7Q9Y6W3 813 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 WDR19Q8NEZ3 1342 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 XKRY2A2RUG3 117 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 TRIM43BA6NCK2 446 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 CLCA1A8K7I4 914 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 RSPH10B2B2RC85 870 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 NFKBIEO00221 500 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 VWA5AO00534 786 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 CXCL11O14625 94 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 ABLIM1O14639 778 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 ARHGAP6O43182 974 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 PROM1O43490 865 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 TGM5O43548 720 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 SULT1B1O43704 296 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 SLC25A17O43808 307 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 CACNG3O60359 315 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 CIDEAO60543 219 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 CCNDBP1O95273 360 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 STAU1O95793 577 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 ALBP02768 609 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 CSF2P04141 144 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 EPHX1P07099 455 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 ANXA6P08133 673 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 CNPP09543 421 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 RSPH10BP0C881 870 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 KRT5P13647 590 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 MTHFD2P13995 350 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 TYRP14679 529 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 VAV1P15498 845 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 LTKP29376 864 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 MAPK4P31152 587 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 RFC2P35250 354 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 WASP42768 502 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 VPS41P49754 854 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 CDR1P51861 262 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 PPP5CP53041 499 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 SLC5A3P53794 718 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 RARSP54136 660 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 GFRA1P56159 465 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 DLG4P78352 724 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 C17orf67Q0P5P2 114 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 LMAN2Q12907 356 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 CHIT1Q13231 466 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 GPM6BQ13491 265 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 ITGA7Q13683 1181 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 LAMB3Q13751 1172 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 NFE2L1Q14494 772 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 SQLEQ14534 574 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 SEC23BQ15437 767 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 ZNF827Q17R98 1081 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 INSCQ1MX18 579 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 TMEM177Q53S58 311 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 SFRP5Q5T4F7 317 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 ERMARDQ5T6L9 678 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU1-101P-201ENST00000391171 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms