RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384006.1

RNU6-641P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 641, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-641P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-641P-201ENST00000384006 COBLL1Q53SF7 1204 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 KIAA0895LQ68EN5 471 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 VWA1Q6PCB0 445 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 SESTD1Q86VW0 696 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 SSH3Q8TE77 659 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 SLC9A6Q92581 669 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 COLEC11Q9BWP8 271 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 WDR11Q9BZH6 1224 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF287Q9HBT7 754 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 COL20A1Q9P218 1284 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 DMTF1Q9Y222 760 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 COL4A3Q01955 1670 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 MYO1CO00159 1063 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 PMM2O15305 246 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 PLIN1O60240 522 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 ITGAMP11215 1152 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 GATA3P23771 443 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 GDF5P43026 501 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 CASP5P51878 434 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF134P52741 427 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 NXPH1P58417 271 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 SATB1Q01826 763 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 ITIH3Q06033 890 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 PTPRRQ15256 657 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 CCDC146Q8IYE0 955 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 PTDSS2Q9BVG9 487 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 TOR3AQ9H497 397 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 CPNE7Q9UBL6 633 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 APAF1O14727 1248 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 TXNP10599 105 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 KRT4P19013 534 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 CHRM3P20309 590 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 CD6P30203 668 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 PXNP49023 591 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 DAG1Q14118 895 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 MGAT5BQ3V5L5 792 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 DCAF12L1Q5VU92 463 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 LAYNQ6UX15 382 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 KSR2Q6VAB6 950 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 SLC30A10Q6XR72 485 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 Q6ZNX1 250 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 LDLRAD3Q86YD5 345 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 LCORLQ8N3X6 602 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 SLC15A4Q8N697 577 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 OR56A3Q8NH54 315 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPSB4Q96A44 273 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 PGBD1Q96JS3 809 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 Q96MF0 132 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 BRIP1Q9BX63 1249 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 PCED1AQ9H1Q7 454 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 SMOC2Q9H3U7 446 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 PNPLA8Q9NP80 782 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 SERHLQ9NQF3 203 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 PADI4Q9UM07 663 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 WDR27A2RRH5 827 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 RHPN2P1A8MT19 583 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 RASA4BC9J798 803 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 F5H697 171 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 MPPED1O15442 326 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 RASA4O43374 803 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 VPS4BO75351 444 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 RHOBTB3O94955 611 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 INMTO95050 263 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 IL18RAPO95256 599 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 ESRRBO95718 433 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 IL1R1P14778 569 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 PPP3CBP16298 524 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 TSHRP16473 764 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 FOLR3P41439 243 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 PIK3CBP42338 1070 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 SEC24CP53992 1094 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 LILRA4P59901 499 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 RPS16P62249 146 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 MPP3Q13368 585 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 PICALMQ13492 652 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms