RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381551.8

PDGFB-202, Transcript of platelet derived growth factor subunit B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDGFB, Length 1,125 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFB-202ENST00000381551 CPB1P15086 417 aa16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 ATF2P15336 505 aa16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 RFX1P22670 979 aa16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 PLCB2Q00722 1185 aa16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 SMARCB1Q12824 385 aa16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 ORC1Q13415 861 aa16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 ADAM15Q13444 863 aa16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 ZNF394Q53GI3 561 aa16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 TMEM270Q6UE05 265 aa16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 EFHBQ8N7U6 833 aa16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 SLC4A11Q8NBS3 891 aa16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 SHC3Q92529 594 aa16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 STK33Q9BYT3 514 aa16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 MAFFQ9ULX9 164 aa16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 FHOD1Q9Y613 1164 aa16.48■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 NCK2O43639 380 aa16.47■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 GLUD1P00367 558 aa16.47■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 EPCAMP16422 314 aa16.47■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 ZNF132P52740 706 aa16.47■□□□□ 0.23
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PDGFB-202ENST00000381551 COL19A1Q14993 1142 aa16.47■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
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PDGFB-202ENST00000381551 C12orf29Q8N999 325 aa16.47■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 ATAD1Q8NBU5 361 aa16.47■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 VN1R2Q8NFZ6 395 aa16.47■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
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PDGFB-202ENST00000381551 TRIM5Q9C035 493 aa16.47■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 GPR88Q9GZN0 384 aa16.47■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 FSD2A1L4K1 749 aa16.46■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 MTMR11A4FU01 709 aa16.46■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 LINC01565O15544 149 aa16.46■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 SEC24AO95486 1093 aa16.46■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 CDR1P51861 262 aa16.46■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 ADCY1Q08828 1119 aa16.46■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 DUSP4Q13115 394 aa16.46■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
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PDGFB-202ENST00000381551 MDH1BQ5I0G3 518 aa16.46■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 TCEAL8Q8IYN2 117 aa16.46■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 MICALL1Q8N3F8 863 aa16.46■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 KREMEN2Q8NCW0 462 aa16.46■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 HDAC7Q8WUI4 952 aa16.46■□□□□ 0.23
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PDGFB-202ENST00000381551 FBXW11Q9UKB1 542 aa16.46■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 KIAA1257Q9ULG3 409 aa16.46■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa16.46■□□□□ 0.23
PDGFB-202ENST00000381551 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa16.46■□□□□ 0.23
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PDGFB-202ENST00000381551 ELF1P32519 619 aa16.45■□□□□ 0.22
PDGFB-202ENST00000381551 JAM2P57087 298 aa16.45■□□□□ 0.22
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PDGFB-202ENST00000381551 LLGL2Q6P1M3 1020 aa16.45■□□□□ 0.22
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PDGFB-202ENST00000381551 CEP72Q9P209 647 aa16.45■□□□□ 0.22
PDGFB-202ENST00000381551 DPP7Q9UHL4 492 aa16.45■□□□□ 0.22
PDGFB-202ENST00000381551 F8VZ95 297 aa16.44■□□□□ 0.22
PDGFB-202ENST00000381551 CYP26A1O43174 497 aa16.44■□□□□ 0.22
PDGFB-202ENST00000381551 GLP2RO95838 553 aa16.44■□□□□ 0.22
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PDGFB-202ENST00000381551 CYP2F1P24903 491 aa16.44■□□□□ 0.22
PDGFB-202ENST00000381551 CLCN1P35523 988 aa16.44■□□□□ 0.22
PDGFB-202ENST00000381551 LTBRP36941 435 aa16.44■□□□□ 0.22
PDGFB-202ENST00000381551 USP8P40818 1118 aa16.44■□□□□ 0.22
PDGFB-202ENST00000381551 CYP27A1Q02318 531 aa16.44■□□□□ 0.22
PDGFB-202ENST00000381551 C4orf50Q6ZRC1 276 aa16.44■□□□□ 0.22
PDGFB-202ENST00000381551 RTL10Q7L3V2 364 aa16.44■□□□□ 0.22
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