RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373779.7

PTPRU-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-202ENST00000373779 PPP1R36Q96LQ0 422 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 MED15Q96RN5 788 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 ABCF3Q9NUQ8 709 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 PCYOX1Q9UHG3 505 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 ZNRF3Q9ULT6 936 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 C15orf41Q9Y2V0 281 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 ZBTB39O15060 712 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 TM9SF1O15321 606 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 VIL1P09327 827 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 RARRES1P49788 294 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 MARSP56192 900 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 MAPRE2Q15555 327 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 SEZ6Q53EL9 994 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 KCNT1Q5JUK3 1230 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 POTEAQ6S8J7 498 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 UBA3Q8TBC4 463 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 CGRRF1Q99675 332 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 NEMP1O14524 444 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 MYL2P10916 166 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 CALB2P22676 271 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 CYP3A7P24462 503 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 SPDYE2Q495Y8 402 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 HGSNATQ68CP4 663 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 C1orf186Q6ZWK4 172 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 SUN2Q9UH99 717 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 L3MBTL1Q9Y468 752 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 SNX9Q9Y5X1 595 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 NUDT17P0C025 328 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 DRD4P21917 467 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 CNGA2Q16280 664 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 DUPD1Q68J44 220 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 ABRAQ8N0Z2 381 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF280CQ8ND82 737 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 ATG4CQ96DT6 458 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 ECM1Q16610 540 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 SHOC2Q9UQ13 582 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 MAGEA13PA6NCF6 341 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 CYP3A4P08684 503 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 RHBDL3P58872 404 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 AGAP3Q96P47 875 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 NT5C1AQ9BXI3 368 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 PCDH9Q9HC56 1237 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 CHST7Q9NS84 486 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 CAP2P40123 477 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 BIRC2Q13490 618 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 ANKRD27Q96NW4 1050 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 ARHGEF37A1IGU5 675 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 VCPP55072 806 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 AUHQ13825 339 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 IER5Q5VY09 327 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 C16orf89Q6UX73 402 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 MMP19Q99542 508 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 SNX3O60493 162 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 GCNT1Q02742 428 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 FAXCQ5TGI0 409 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF560Q96MR9 790 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 MTMR12Q9C0I1 747 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 LSM8O95777 96 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 NAMPTP43490 491 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 DSG1Q02413 1049 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 PDP2Q9P2J9 529 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 GAKO14976 1311 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 DRG2P55039 364 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 EPS8L1Q8TE68 723 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 NFIBO00712 420 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 COPAP53621 1224 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 TEKT4Q8WW24 435 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 SPRP35270 261 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 WASHC2DQ5SRD0 308 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 STYK1Q6J9G0 422 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 TNIP3Q96KP6 325 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 C19orf81C9J6K1 198 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 AGPSO00116 658 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 TLR2O60603 784 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 DLG4P78352 724 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 BOLA3Q53S33 107 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 LRRC71Q8N4P6 559 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 MYLK2Q9H1R3 596 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRU-202ENST00000373779 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms