RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF286BP0CG31 522 aa21.99■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 SHMT1P34896 483 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 SLC30A10Q6XR72 485 aa21.99■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 LACRTQ9GZZ8 138 aa21.99■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 ERO1BQ86YB8 467 aa21.99■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 PTK2BQ14289 1009 aa21.98■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 SLC40A1Q9NP59 571 aa21.98■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa21.98■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 NDE1Q9NXR1 346 aa21.98■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 POLBP06746 335 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 MYL2P10916 166 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 KCNT1Q5JUK3 1230 aa21.97■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 ZSWIM1Q9BR11 485 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 SYCE1LA8MT33 242 aa21.97■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 MDM1Q8TC05 714 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 SCFD1Q8WVM8 642 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 FAM47DPA6NHR8 397 aa21.97■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF197O14709 1029 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 AP1G2O75843 785 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 HIST1H2ADP20671 130 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 SARSP49591 514 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 HIST1H2AJQ99878 128 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 H2AFJQ9BTM1 129 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 CPA4Q9UI42 421 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 AURKCQ9UQB9 309 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 TMEM120BA0PK00 339 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 CCT8L1PA6NM43 557 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 CASP7P55210 303 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 FIGNQ5HY92 759 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 NUDT18Q6ZVK8 323 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC90BQ9GZT6 254 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 WDCPQ9H6R7 721 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 MYOM1P52179 1685 aa21.97■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 CYP11B1P15538 503 aa21.96■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 TGFB2P61812 414 aa21.96■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 PGM5Q15124 567 aa21.96■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa21.96■■□□□ 1.11
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SMURF1-201ENST00000361125 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.96■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa21.96■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 CD274Q9NZQ7 290 aa21.96■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 RGL2O15211 777 aa21.96■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.96■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 LZICQ8WZA0 190 aa21.96■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 TFRCP02786 760 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 EPHB2P29323 1055 aa21.96■■□□□ 1.11
SMURF1-201ENST00000361125 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
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