RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 ALDH9A1P49189 494 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 EPHB3P54753 998 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 NCKAP1LP55160 1127 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 CDC42EP1Q00587 391 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 KCNA10Q16322 511 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 ZACNQ401N2 412 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 RGMBQ6NW40 437 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 OLFM4Q6UX06 510 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.392e-18■□□□□ 10.9
CCL20-201ENST00000358813 MZB1Q8WU39 189 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 SAMD11Q96NU1 681 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 SERHLQ9NQF3 203 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 GALNT8Q9NY28 637 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 CPA4Q9UI42 421 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 IRAK3Q9Y616 596 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 A0A1W2PPC4 97 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 IRAK2O43187 625 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 NF2P35240 595 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 RAB39AQ14964 217 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 SLC35G1Q2M3R5 365 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 CST9Q5W186 159 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 CD276Q5ZPR3 534 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 TTLL5Q6EMB2 1281 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 RSPH3Q86UC2 560 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 SESTD1Q86VW0 696 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 ALG3Q92685 438 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 TOX2Q96NM4 488 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 AMNQ9BXJ7 453 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 STK33Q9BYT3 514 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 VPS33BQ9H267 617 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 WDCPQ9H6R7 721 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 RASSF1Q9NS23 344 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 DTLQ9NZJ0 730 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 ABCF2Q9UG63 623 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 SLX4Q8IY92 1834 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 AKR1B10O60218 316 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 SNX2O60749 519 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 PHF2O75151 1096 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 RAD17O75943 681 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 PFKLP17858 780 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 LINC00310P59036 64 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 MGAT5Q09328 741 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 SEPT2Q15019 361 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 PFKFB4Q16877 469 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 RETSATQ6NUM9 610 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 BEND5Q7L4P6 421 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 MUL1Q969V5 352 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 BTBD2Q9BX70 525 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.34□□□□□ -1.39
CCL20-201ENST00000358813 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.34□□□□□ -1.39
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