RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326181.10

TRAF7-201, Transcript of TNF receptor associated factor 7, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF7, Length 3,700 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7-201ENST00000326181 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 VPS52Q8N1B4 723 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 FAM71DQ8N9W8 422 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 NRXN2Q9P2S2 1712 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 MAP3K6O95382 1288 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 PSEN1P49768 467 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 ACTR2P61160 394 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 TRIM72Q6ZMU5 477 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 CNKSR1Q969H4 720 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 MTMR12Q9C0I1 747 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.141e-7■■■■□ 21.2
TRAF7-201ENST00000326181 STAM2O75886 525 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 PHBP35232 272 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 CCDC15Q0P6D6 951 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 RFX6Q8HWS3 928 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 ASAP3Q8TDY4 903 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 LRRN4Q8WUT4 740 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 FAM111AQ96PZ2 611 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 NUMBLQ9Y6R0 609 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 TMEM191CA6NGB0 347 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 MT-ND3P03897 115 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 KRT19P08727 400 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 CD48P09326 243 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 TMEM191BP0C7N4 346 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 TPBGLP0DKB5 382 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 ARL4CP56559 192 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 MYL6P60660 151 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 PTP4A2Q12974 167 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 MANSC1Q9H8J5 431 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 ARMCX1Q9P291 453 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 SLC9A2Q9UBY0 812 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 WDR46O15213 610 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 ALOX15BO15296 676 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 GYG2O15488 501 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 SERPINB3P29508 390 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 PTPRN2Q92932 1015 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 LPXNO60711 386 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 HAUS5O94927 633 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 MMP8P22894 467 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 ATP11CQ8NB49 1132 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 CLUHO75153 1309 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 KITP10721 976 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 YY1P25490 414 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 MARK3P27448 753 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 TRPC3Q13507 836 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 DSTYKQ6XUX3 929 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 CLNKQ7Z7G1 428 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 LMNTD2Q8IXW0 634 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 ARL8BQ9NVJ2 186 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 SENP1Q9P0U3 644 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 RABGEF1Q9UJ41 708 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 TYROBPO43914 113 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 ARFIP2P53365 341 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 TMEM130Q8N3G9 435 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 TMEM35BQ8NCS4 154 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 CFAP36Q96G28 342 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 TSSK1BQ9BXA7 367 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 TRIM55Q9BYV6 548 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 TTLL13PA6NNM8 815 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.143e-6■■■■□ 19.3
TRAF7-201ENST00000326181 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 BGNP21810 368 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 RCN2Q14257 317 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 RCN1Q15293 331 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 PARP6Q2NL67 630 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 KCTD6Q8NC69 237 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 TMEM174Q8WUU8 243 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 PLA2G6O60733 806 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 AVILO75366 819 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 PTPN4P29074 926 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAF7-201ENST00000326181 CDKN2BP42772 138 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms