RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa10.8□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 GLI1P08151 1106 aa10.8□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 HPDP32754 393 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 CDK17Q00537 523 aa10.8□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 TBC1D25Q3MII6 688 aa10.8□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 SFMBT2Q5VUG0 894 aa10.8□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 C8orf74Q6P047 294 aa10.8□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 BEST2Q8NFU1 509 aa10.8□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 KIF12Q96FN5 646 aa10.8□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 APOL6Q9BWW8 343 aa10.8□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 MTMR12Q9C0I1 747 aa10.8□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 NLRC4Q9NPP4 1024 aa10.8□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 TMEM39AQ9NV64 488 aa10.8□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 ITGA11Q9UKX5 1188 aa10.8□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 TBX21Q9UL17 535 aa10.8□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP10.8□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 PLAGL2Q9UPG8 496 aa10.8□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 A6NHS1 94 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 TTC36A6NLP5 189 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 ATP2C2O75185 946 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 VNN1O95497 513 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 EOMESO95936 686 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 NFICP08651 508 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 PAEPP09466 180 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 CLTBP09497 229 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 TCP1P17987 556 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 CYP3A5P20815 502 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 AKAP5P24588 427 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 ATICP31939 592 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 RFC2P35250 354 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 MFAP3P55082 362 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 PPP1R7Q15435 360 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 CCDC170Q8IYT3 715 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 DPP3Q9NY33 737 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 L3MBTL1Q9Y468 752 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 HES2Q9Y543 173 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 CHD9Q3L8U1 2897 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 LRRC53A6NM62 1247 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 MGEA5O60502 916 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 LINGO3P0C6S8 592 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 STAT1P42224 750 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 JAM2P57087 298 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 RBP5P82980 135 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 GCNT1Q02742 428 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 KIF5AQ12840 1032 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 BLMHQ13867 455 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 ZBTB6Q15916 424 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 LRRC26Q2I0M4 334 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 SLC24A5Q71RS6 500 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 TSGA10Q9BZW7 698 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 RNF39Q9H2S5 420 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 SLC38A7Q9NVC3 462 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 AIPL1Q9NZN9 384 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa10.79□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 NBNO60934 754 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 TACC1O75410 805 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 ASS1P00966 412 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 CXCL10P02778 98 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 FERP16591 822 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 CDC25CP30307 473 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 FAM189BP81408 668 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 RAPGEF1Q13905 1077 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 CCDC181Q5TID7 509 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 ECHDC2Q86YB7 292 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 YIPF3Q9GZM5 350 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 EPB41L5Q9HCM4 733 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 EHD2Q9NZN4 543 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 SLC12A4Q9UP95 1085 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 PLAAQ9Y263 795 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 HYOU1Q9Y4L1 999 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 CCT8L1PA6NM43 557 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 STAU1O95793 577 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 CST3P01034 146 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 GSTA1P08263 222 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 ALADP13716 330 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 SOX5P35711 763 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 CYP27A1Q02318 531 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 ASIC2Q16515 512 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 SLC30A9Q6PML9 568 aa10.78□□□□□ -0.68
GINS3-201ENST00000318129 LRIG3Q6UXM1 1119 aa10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms