RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 RARAP10276 462 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 CYP3A5P20815 502 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 GPD2P43304 727 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 NIPA2Q8N8Q9 360 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 RUNDC3BQ96NL0 473 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 RNF19AQ9NV58 838 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 PCYOX1Q9UHG3 505 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 SIGLEC16A6NMB1 481 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 H3BQF6 201 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 RPS6KA5O75582 802 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 OGDHQ02218 1023 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 PDCLQ13371 301 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 KCNA10Q16322 511 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 FBXO47Q5MNV8 452 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 MAIP1Q8WWC4 291 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 SYNCQ9H7C4 482 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 TJP2Q9UDY2 1190 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 HTTP42858 3142 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 ERBB2P04626 1255 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 ECHS1P30084 290 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 PNPLA4P41247 253 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 GABRB2P47870 512 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 XYLT1Q86Y38 959 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 ARRDC4Q8NCT1 418 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 FAM114A2Q9NRY5 505 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 GOLGA8SH3BPF8 625 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 CHRNA1P02708 482 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 CTSHP09668 335 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 FAM153BP0C7A2 387 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 SSR1P43307 286 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 MGAT3Q09327 533 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 FAM153CQ494X1 144 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 LRRC38Q5VT99 294 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 UNC93AQ86WB7 457 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 TRIM51Q9BSJ1 452 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 SAGE1Q9NXZ1 904 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 FAM153AQ9UHL3 310 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 RASAL2Q9UJF2 1139 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 TSPAN16Q9UKR8 245 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 FKTNO75072 461 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 KRT3P12035 628 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 PTGIRP43119 386 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 TTC27Q6P3X3 843 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 DPH6Q7L8W6 267 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 JAMLQ86YT9 394 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 EXD1Q8NHP7 514 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 CHST12Q9NRB3 414 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD8-201ENST00000313173 DAPK3O43293 454 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 FNTAP49354 379 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 SOWAHAQ2M3V2 549 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 MREGQ8N565 214 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 UBA3Q8TBC4 463 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 FNIP1Q8TF40 1166 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 GDAP2Q9NXN4 497 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 COILP38432 576 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 MCRS1Q96EZ8 462 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 PKNOX2Q96KN3 472 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 ERP44Q9BS26 406 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 LRRC19Q9H756 370 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 MED4Q9NPJ6 270 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 NME7Q9Y5B8 376 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 KPNA7A9QM74 516 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 F8VP50 259 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 TAF6P49848 677 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 DUPD1Q68J44 220 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 ACOT1Q86TX2 421 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC50Q8IVM0 306 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 GRIN2DO15399 1336 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 GNRH1P01148 92 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 GJC1P36383 396 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 SV2CQ496J9 727 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 HSP90B2PQ58FF3 399 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 C12orf29Q8N999 325 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 OR6B3Q8NGW1 331 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 JOSD2Q8TAC2 188 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 RAET1EQ8TD07 263 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 MIS12Q9H081 205 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 FAM105AQ9NUU6 356 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 PTGESO14684 152 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 SPTLC1O15269 473 aa28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms