RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa21.1■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC52Q8N7C0 313 aa21.1■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 MAB21L3Q8N8X9 362 aa21.1■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM206Q9H813 350 aa21.1■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 PDE11AQ9HCR9 933 aa21.1■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 GMEB2Q9UKD1 530 aa21.1■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 ITGA11Q9UKX5 1188 aa21.1■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 RAB23Q9ULC3 237 aa21.1■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 GPR179Q6PRD1 2367 aa21.1■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 FRYLO94915 3013 aa21.1■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 KRT19P08727 400 aa21.09■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 AVPR1AP37288 418 aa21.09■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 LPAL2Q16609 132 aa21.09■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa21.09■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC65Q8IXS2 484 aa21.09■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 STKLD1Q8NE28 680 aa21.09■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 CXorf38Q8TB03 319 aa21.09■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 ACBD6Q9BR61 282 aa21.09■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 GKN1Q9NS71 199 aa21.09■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 DMXL1Q9Y485 3027 aa21.09■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 DENND4CQ5VZ89 1909 aa21.08■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM191BP0C7N4 346 aa21.08■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 CSH1P0DML2 217 aa21.08■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 CSH2P0DML3 217 aa21.08■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 NASPP49321 788 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 RBP5P82980 135 aa21.08■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 MYL7Q01449 175 aa21.08■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.08■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM86AQ8N2M4 240 aa21.08■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 GPD1LQ8N335 351 aa21.08■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 MTMR12Q9C0I1 747 aa21.08■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 GDAP2Q9NXN4 497 aa21.08■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 USP18Q9UMW8 372 aa21.08■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 CCL26Q9Y258 94 aa21.08■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 SNX9Q9Y5X1 595 aa21.08■□□□□ 0.97
CXCL3-201ENST00000296026 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 STX6O43752 255 aa21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 CYP2F1P24903 491 aa21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 FNTBP49356 437 aa21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 DMWDQ09019 674 aa21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 CCINQ13939 588 aa21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 STK38Q15208 465 aa21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 DDR2Q16832 855 aa21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 TXNDC8Q6A555 127 aa21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 PRR23BQ6ZRT6 265 aa21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 OSTM1Q86WC4 334 aa21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 PKMYT1Q99640 499 aa21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 FAM83CQ9BQN1 747 aa21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 ABCB6Q9NP58 842 aa21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 SIX4Q9UIU6 781 aa21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 OBSL1O75147 1896 aa21.07■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 K7ESF4 209 aa21.06■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 TGM1P22735 817 aa21.06■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 LMNB2Q03252 620 aa21.06■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC142Q17RM4 750 aa21.06■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 LAIR1Q6GTX8 287 aa21.06■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa21.06■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 ADGRF2Q8IZF7 708 aa21.06■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 SYNPOQ8N3V7 929 aa21.06■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 TOP6BLQ8N6T0 577 aa21.06■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.06■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 GLIS3Q8NEA6 775 aa21.06■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 SPATA18Q8TC71 538 aa21.06■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 HPS3Q969F9 1004 aa21.06■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa21.06■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 TDP1Q9NUW8 608 aa21.06■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 C2orf42Q9NWW7 574 aa21.06■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 CACNA1AO00555 2505 aa21.05■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 SOBPA7XYQ1 873 aa21.05■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 HRO43593 1189 aa21.05■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 HCRTO43612 131 aa21.05■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 LHX1P48742 406 aa21.05■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 RUNX3Q13761 415 aa21.05■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 SOWAHAQ2M3V2 549 aa21.05■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 TRIM68Q6AZZ1 485 aa21.05■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 MON1AQ86VX9 555 aa21.05■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 LONP2Q86WA8 852 aa21.05■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC27Q9C0I9 530 aa21.05■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 TNMDQ9H2S6 317 aa21.05■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 EBF3Q9H4W6 596 aa21.05■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 KIF9Q9HAQ2 790 aa21.05■□□□□ 0.96
CXCL3-201ENST00000296026 PARD6AQ9NPB6 346 aa21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms