RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255304.8

USPL1-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USPL1, Length 3,814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1-201ENST00000255304 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
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USPL1-201ENST00000255304 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
USPL1-201ENST00000255304 TJP3O95049 919 aa7.98□□□□□ -1.13
USPL1-201ENST00000255304 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
USPL1-201ENST00000255304 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa7.98□□□□□ -1.13
USPL1-201ENST00000255304 CYP2C9P11712 490 aa7.98□□□□□ -1.13
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