RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253462.7

GINS2-201, Transcript of GINS complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS2, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2-201ENST00000253462 CHKAP35790 457 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 VPS41P49754 854 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 TMEM132DQ14C87 1099 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 LONRF1Q17RB8 773 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 CCDC50Q8IVM0 306 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 VCPIP1Q96JH7 1222 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 HEMGNQ9BXL5 484 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 FAM129AQ9BZQ8 928 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 PARVAQ9NVD7 372 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 CREB1P16220 341 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 MMP13P45452 471 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 KRT17Q04695 432 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 CLUL1Q15846 466 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 CYP1B1Q16678 543 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 SGO2Q562F6 1265 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 DENND1BQ6P3S1 775 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 TMEM35BQ8NCS4 154 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 CXorf38Q8TB03 319 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 FEZF2Q8TBJ5 459 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 CHMP6Q96FZ7 201 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 MCEEQ96PE7 176 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 ASB7Q9H672 318 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 TJP2Q9UDY2 1190 aa17.03■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 C5orf60A6NFR6 353 aa17.02■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 CYP2C9P11712 490 aa17.02■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 SPDYCQ5MJ68 293 aa17.02■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 CATSPER4Q7RTX7 472 aa17.02■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 DNAJB3Q8WWF6 145 aa17.02■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 PGM2Q96G03 612 aa17.02■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 HPDLQ96IR7 371 aa17.02■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 AAASQ9NRG9 546 aa17.02■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 KLHL11Q9NVR0 708 aa17.02■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 SNTG2Q9NY99 539 aa17.02■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 SCINQ9Y6U3 715 aa17.02■□□□□ 0.32
GINS2-201ENST00000253462 ECEL1O95672 775 aa17.02■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 MYL3P08590 195 aa17.02■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 TCF4P15884 667 aa17.02■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 SLC1A1P43005 524 aa17.02■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 RAD23BP54727 409 aa17.02■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 AUHQ13825 339 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa17.02■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 PRUNE1Q86TP1 453 aa17.02■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 ZNF410Q86VK4 478 aa17.02■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 ERICH1Q86X53 443 aa17.02■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 KIF12Q96FN5 646 aa17.02■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 PASKQ96RG2 1323 aa17.02■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 BCO2Q9BYV7 579 aa17.02■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 ADAMTS10Q9H324 1103 aa17.02■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 DPP3Q9NY33 737 aa17.02■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 RRN3P2A6NIE6 340 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 RASGRF2O14827 1237 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 GPR32O75388 356 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 F2P00734 622 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 PDE4CQ08493 712 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 MFSD10Q14728 455 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 LRRC14Q15048 493 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 DCUN1D2Q6PH85 259 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 LRRC34Q8IZ02 419 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 ASIC3Q9UHC3 531 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 SCN1AP35498 2009 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 NRCAMQ92823 1304 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 RARGP13631 454 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 GLRA4Q5JXX5 417 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 MGARPQ8TDB4 240 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 CCDC114Q96M63 670 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 APOL6Q9BWW8 343 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 CYTH4Q9UIA0 394 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 GGA2Q9UJY4 613 aa17.01■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 GOLGA8SH3BPF8 625 aa17■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 FSCN2O14926 492 aa17■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 TREHO43280 583 aa17■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 MNAT1P51948 309 aa17■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa17■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 DNAJC24Q6P3W2 148 aa17■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 SAPCD2Q86UD0 394 aa17■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 SLC4A11Q8NBS3 891 aa17■□□□□ 0.31
GINS2-201ENST00000253462 PLVAPQ9BX97 442 aa17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms