RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251968.3

TSG101-201, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSG101, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-201ENST00000251968 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 LHX1P48742 406 aa20.4■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 LCLAT1Q6UWP7 414 aa20.4■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 MON1BQ7L1V2 547 aa20.4■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.4■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 KIF18AQ8NI77 898 aa20.4■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 UBA3Q8TBC4 463 aa20.4■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 RFFLQ8WZ73 363 aa20.4■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 TNIP3Q96KP6 325 aa20.4■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.4■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 CYTH4Q9UIA0 394 aa20.4■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.39■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 ALDH2P05091 517 aa20.39■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 CASQ1P31415 396 aa20.39■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 CCDC142Q17RM4 750 aa20.39■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa20.39■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.39■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa20.39■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 LRRC43Q8N309 656 aa20.39■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.39■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 ADAM22Q9P0K1 906 aa20.39■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.39■□□□□ 0.86
TSG101-201ENST00000251968 EFCAB14O75071 495 aa20.39■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 TADA2AO75478 443 aa20.39■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 CYP11A1P05108 521 aa20.39■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 CCDC130P13994 396 aa20.39■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 PBX3P40426 434 aa20.39■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 SLC11A1P49279 550 aa20.39■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 STILQ15468 1287 aa20.39■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 KIAA0319Q5VV43 1072 aa20.39■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.39■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 TRIM58Q8NG06 486 aa20.39■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 DNAI2Q9GZS0 605 aa20.39■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.39■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 COG5Q9UP83 839 aa20.39■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.39■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.38■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 GPD2P43304 727 aa20.38■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 CDR1P51861 262 aa20.38■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 PTP4A2Q12974 167 aa20.38■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 METTL23Q86XA0 190 aa20.38■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 TNS4Q8IZW8 715 aa20.38■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.38■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 ADAM28Q9UKQ2 775 aa20.38■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 PALMO75781 387 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 BAIAP3O94812 1187 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 CYP1A2P05177 515 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 GALTP07902 379 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 SYN1P17600 705 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 MMP8P22894 467 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 RRM1P23921 792 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 ADORA2BP29275 332 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 BCAR1P56945 870 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 FPGSQ05932 587 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 ZNF365Q70YC5 407 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 TTC30AQ86WT1 665 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 ERICH1Q86X53 443 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 RHOT2Q8IXI1 618 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 SYT15Q9BQS2 421 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 MARCH5Q9NX47 278 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 DSEQ9UL01 958 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 PCDHB8Q9UN66 801 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 ENC1O14682 589 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 MYBL1P10243 752 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 TPCN2Q8NHX9 752 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 TRIM11Q96F44 468 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 VCPIP1Q96JH7 1222 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 NUP85Q9BW27 656 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 HESX1Q9UBX0 185 aa20.37■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 ARHGEF37A1IGU5 675 aa20.36■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 ZBBXA8MT70 800 aa20.36■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 TRAPPC3O43617 180 aa20.36■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 FGBP02675 491 aa20.36■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 TYMPP19971 482 aa20.36■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 PTPN20Q4JDL3 420 aa20.36■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 PKDCCQ504Y2 493 aa20.36■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.36■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 SPATA18Q8TC71 538 aa20.36■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 CPXM1Q96SM3 734 aa20.36■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.36■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 CWH43Q9H720 699 aa20.36■□□□□ 0.85
TSG101-201ENST00000251968 TJP2Q9UDY2 1190 aa20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms