RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000084589.10

Cln3-202, Transcript of Battenin, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cln3, Length 3,203 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3-202ENSMUST00000084589 Trib2Q8K4K3 343 aa9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Slc26a7Q8R2Z3 656 aa9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Tpd52l2Q9CYZ2 220 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Snx29Q9D3S3 818 aa9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Gstt4Q9D4P7 240 aa9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Apol11aE9PZG0 334 aa9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Becn2P0DM65 447 aa9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Atf2P16951 487 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 MagohP61327 146 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Sh3bp2Q06649 559 aa9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Trmt1Q3TX08 663 aa9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Icam5Q60625 917 aa9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Birc2Q62210 612 aa9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Ndrg1Q62433 394 aa9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Arhgef18Q6P9R4 1021 aa9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Cct8l1Q80YT3 562 aa9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Arhgap15Q811M1 481 aa9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Mcoln2Q8K595 566 aa9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Olfr356Q8VFP5 315 aa9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Zmynd10Q99ML0 440 aa9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 MagohbQ9CQL1 146 aa9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Gpihbp1Q9D1N2 228 aa9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Ftsj3Q9DBE9 838 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Robo3Q9Z2I4 1366 aa9.9□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Ttc17E9PVB5 1198 aa9.9□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Gm5795E9PZN8 263 aa9.9□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 TnfP06804 235 aa9.9□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Vav1P27870 845 aa9.9□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Gad2P48320 585 aa9.9□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 SftpbP50405 377 aa9.9□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 RelaQ04207 549 aa9.9□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Tmprss11aQ3UQ41 389 aa9.9□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 IqceQ6PCQ0 778 aa9.9□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 GancQ8BVW0 898 aa9.9□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 ClmnQ8C5W0 1052 aa9.9□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Stau2Q8CJ67 570 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 OafQ8QZR4 282 aa9.9□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Uroc1Q8VC12 676 aa9.9□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Lrrc14Q8VC16 493 aa9.9□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Ttc1Q91Z38 292 aa9.9□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Mcur1Q9CXD6 340 aa9.9□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Prpf4Q9DAW6 521 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Mrpl4Q9DCU6 294 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Mindy4b-psA0A1W2P7H6 457 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Fam171a1A2ATK9 892 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Mup10A2BIN1 180 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Mup14A2CEK7 180 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Mup19A9C497 187 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Mup15A9R9W0 180 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Mup17B5X0G2 180 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Mup8E9PVW0 235 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Prdm15E9Q8T2 1174 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Mup7E9QA79 235 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Nek2O35942 443 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Mup6P02762 180 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Mup1P11588 180 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Mup2P11589 180 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Pou2f2Q00196 463 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Sox13Q04891 613 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Gpr15Q0VDU3 360 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Zbtb8osQ505B7 168 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Ttyh3Q6P5F7 524 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Rd3Q8BRE0 195 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Apol9bQ8C7I4 310 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Defb19Q8K3I8 83 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Apol9aQ8VDU3 310 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Olfr532Q8VGT4 309 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Rnf112Q96DY5 654 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Krt20Q9D312 431 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Polr3cQ9D483 533 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Hsf2bpQ9D4G2 338 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Iigp1Q9QZ85 413 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Cetn2Q9R1K9 172 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Myo7aP97479 2215 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Gm4302E9PX25 294 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Ptp4a2O70274 167 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Casp14O89094 257 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Ranbp1P34022 203 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 YwhaeP62259 255 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Tmprss15P97435 1069 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Ptgs2Q05769 604 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Ttc39dQ0VF76 604 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Zmym1Q3TJB1 983 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Atp13a5Q3TYU2 1216 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Ubn1Q4G0F8 1135 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Arhgap44Q5SSM3 814 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 CochQ62507 552 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Armcx2Q6A058 784 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Tsga10Q6NY15 697 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 WtipQ7TQJ8 398 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 EmsyQ8BMB0 1264 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Amz1Q8BVF9 502 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Dus1lQ8C2P3 475 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Sgip1Q8VD37 806 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 CarfQ8VHI4 689 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Dkc1Q9ESX5 509 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Slc5a4aQ9ET37 656 aa9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 Wdr46Q9Z0H1 622 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Cln3-202ENSMUST00000084589 TfgQ9Z1A1 397 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.6 ms