RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026474.4

Gli1-201, Transcript of Zinc finger protein GLI1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gli1, Length 4,057 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1-201ENSMUST00000026474 Stk10O55098 966 aa15.22■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Syne3Q4FZC9 975 aa15.22■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Trim37Q6PCX9 961 aa15.22■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Pknox2Q8BG99 474 aa15.22■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Lrrc66Q8K0B3 872 aa15.22■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cep19Q9CQA8 163 aa15.22■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rmdn1Q9DCV4 305 aa15.22■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Zscan4dA7KBS4 506 aa15.22■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Sec14l1A8Y5H7 715 aa15.22■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cfap221A9Q751 836 aa15.22■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Lmnb2P21619 596 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Lmo2P25801 158 aa15.22■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ercc5P35689 1170 aa15.22■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Plk1Q07832 603 aa15.22■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Zscan4fQ3URS2 506 aa15.22■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ssxb10Q6XAR7 170 aa15.22■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Zscan4cQ80VJ6 506 aa15.22■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rhpn2Q8BWR8 686 aa15.22■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kctd15Q8K0E1 283 aa15.22■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ablim1Q8K4G5 861 aa15.22■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rfx8D3YU81 596 aa15.21■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kif3cO35066 796 aa15.21■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Fgfr1P16092 822 aa15.21■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gdf6P43028 454 aa15.21■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Anks6Q6GQX6 883 aa15.21■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rufy1Q8BIJ7 712 aa15.21■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tdrd7Q8K1H1 1086 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Q922C1 641 aa15.21■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Fam187aQ9D3R5 417 aa15.21■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 ZxdbA2CE44 873 aa15.21■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kctd19Q562E2 927 aa15.21■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Zfp251Q6PCX8 632 aa15.21■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rad9bQ6WBX7 403 aa15.21■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 SugctQ7TNE1 436 aa15.21■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 PdhxQ8BKZ9 501 aa15.21■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Slc26a3Q9WVC8 757 aa15.21■□□□□ 0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Hspa8P63017 646 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ccdc157Q5SPX1 718 aa15.21■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Erlin2Q8BFZ9 340 aa15.21■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Spata2Q8K004 515 aa15.21■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Spatc1lQ9D9W0 342 aa15.21■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Xab2Q9DCD2 855 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Eif2ak3Q9Z2B5 1114 aa15.21■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Trim43aQ3TL54 445 aa15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Nr2c1Q505F1 590 aa15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Vav2Q60992 868 aa15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 DstykQ6XUX1 927 aa15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Lrfn2Q80TG9 788 aa15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Baiap3Q80TT2 1134 aa15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm5622Q810Q0 167 aa15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 NumbQ9QZS3 653 aa15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ism1A2ATD1 454 aa15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kif2bQ8C0N1 668 aa15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Smtnl2Q8CI12 456 aa15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rrp1bQ91YK2 724 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Col4a3Q9QZS0 1669 aa15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm10721J3QPJ9 223 aa15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Hes2O54792 157 aa15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kpna1Q60960 538 aa15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gpsm1Q6IR34 673 aa15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tmem202Q80W35 275 aa15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Metap1Q8BP48 386 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 UvragQ8K245 698 aa15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Dnajb2Q9QYI5 324 aa15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Zranb2Q9R020 330 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ccnyl1D3YUJ3 367 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm3182K7N6T8 263 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Per2O54943 1257 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Odc1P00860 461 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 SbdsP70122 250 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 ArvcfP98203 962 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gse1Q3U3C9 1213 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm11487Q5RIS0 354 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Acvrl1Q61288 502 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gpatch2lQ6PE65 482 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cyth4Q80YW0 393 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Eml3Q8VC03 897 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Pin4Q9CWW6 131 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Fam81bA0A140LI28 432 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm27029A2A4P4 543 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm1758F6VZZ1 202 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Vmn2r77L7N2B7 854 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Impa1O55023 277 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gpr15Q0VDU3 360 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Znf800Q0VEE6 662 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tmem26Q3UP23 366 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Sema4bQ62179 823 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Fez2Q6TYB5 348 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ints6lQ8BND4 861 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Dis3lQ8C0S1 1053 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Pip4k2cQ91XU3 421 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Lrrc57Q9D1G5 239 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Dcaf6Q9DC22 876 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm4756A0A140LIS8 335 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm45713A0A1B0GS68 446 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gjb3P28231 270 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Wdr35Q8BND3 1181 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Unc5bQ8K1S3 945 aa15.19■□□□□ 0.02
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rfx5Q9JL61 658 aa15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.3 ms