RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeastyeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP4YHR069C SHH3Q04487 196 aa4.51□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C AVO2Q04749 426 aa4.51□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C ORM2Q06144 216 aa4.51□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C CTR3Q06686 241 aa4.51□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C PAA1Q12447 191 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C ZRC1P20107 442 aa4.5□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C QCR9P22289 66 aa4.5□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C SHB17P36136 271 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C YBR292CP38357 123 aa4.5□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C GLE2P40066 365 aa4.5□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C MIC27P50945 234 aa4.5□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C PET494P07390 489 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C PRY2P36110 329 aa4.49□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C CDS1P38221 457 aa4.49□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C MIC12P38341 106 aa4.49□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C SNN1P48232 102 aa4.49□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C YAP1802P53309 568 aa4.49□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C TMA23Q03525 211 aa4.49□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C HOR7Q05827 59 aa4.49□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C SDO1Q07953 250 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C CYC3P06182 269 aa4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C CDC7P06243 507 aa4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C YHR213WP0CI67 198 aa4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C YER190C-BP0CX94 160 aa4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C YEL077W-AP0CX95 160 aa4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C YGR296C-BP0CX96 160 aa4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C YPL283W-BP0CX97 160 aa4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C YPR204C-AP0CX98 160 aa4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C YFL068WP0CX99 160 aa4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C YLL066W-AP0CY00 160 aa4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C YLL067W-AP0CY01 160 aa4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C MRP2P10663 115 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C POP5P28005 173 aa4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C MSK1P32048 576 aa4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C AVT5P38176 459 aa4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C RRT1P38192 103 aa4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C DER1P38307 211 aa4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C RIB4P50861 169 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C YMR181CQ03231 154 aa4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C VMA9Q3E7B6 73 aa4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C YBR182C-AQ8TGU6 64 aa4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C Q0142Q9ZZW4 58 aa4.48□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C YKL102CP34249 101 aa4.47□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C RPL14AP36105 138 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C RPL14BP38754 138 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C PET100P38958 111 aa4.47□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C AGE2P40529 298 aa4.47□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C SAS2P40963 338 aa4.47□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C SMD3P43321 101 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C IMP2P46972 177 aa4.47□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C ATG27P46989 271 aa4.47□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C TOS8P53147 276 aa4.47□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C CPD1P53314 239 aa4.47□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C HST4P53688 370 aa4.47□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C TIM18Q08749 192 aa4.47□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C YPR013CQ12145 317 aa4.47□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C AYT1Q12226 474 aa4.47□□□□□ -1.69
RRP4YHR069C ALK2P32789 676 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C YKL075CP36083 450 aa4.46□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C SHG1P38337 142 aa4.46□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C IMD2P38697 523 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C SNU13P39990 126 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C YNL194CP40169 301 aa4.46□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C LOC1P43586 204 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C RPA43P46669 326 aa4.46□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C DSK2P48510 373 aa4.46□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C CAB4P53332 305 aa4.46□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C CAF40P53829 373 aa4.46□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C ERV25P54837 211 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C ERV2Q12284 196 aa4.46□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C LDS1P31379 325 aa4.45□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C SFT2P38166 215 aa4.45□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C LSM2P38203 95 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C TRS20P38334 175 aa4.45□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C YIL024CP40543 189 aa4.45□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C RTS2P40962 232 aa4.45□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C MCM22P47167 239 aa4.45□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C YDL186WP48568 277 aa4.45□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C PAU4P53427 120 aa4.45□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C OCA2P53949 197 aa4.45□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C ATC1Q04005 294 aa4.45□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C DIF1O13577 133 aa4.44□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data4.44□□□□□ -1.7not detected
RRP4YHR069C YHR212W-AP0CX91 67 aa4.44□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C RPS0AP32905 252 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C SDH7Q04401 133 aa4.44□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C YMR253CQ04835 414 aa4.44□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C PRM3Q08931 133 aa4.44□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C SME1Q12330 94 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C YGR035W-AQ45U48 73 aa4.44□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C PAU1P0CE88 120 aa4.43□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C PAU14P0CE89 120 aa4.43□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C PAU6P0CE90 120 aa4.43□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C PAU18P0CE91 120 aa4.43□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C PAU8P0CE92 120 aa4.43□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C PAU11P0CE93 120 aa4.43□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C SRB6P32570 121 aa4.43□□□□□ -1.7
RRP4YHR069C ICS2P38284 255 aa4.43□□□□□ -1.7
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