RNA–Protein interactions for RNA: YHR014W

SPO13, Transcript of Meiotic regulator, yeast

Gene SPO13, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPO13	YHR014W	YOL024W	Q08172	172 aa		0.78	□□□□□ -2.28
SPO13	YHR014W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	0.77	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	0.77	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	TRM5	P38793	499 aa		0.77	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	IKI1	P38874	309 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	AIM25	P47140	327 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	RNH202	Q05635	350 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	MDM32	Q12171	622 aa		0.76	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	YEA4	P40004	342 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	GET1	P53192	235 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	DAD4	P69851	72 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	IRC23	Q08416	157 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	FIT2	Q08906	153 aa		0.75	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	PHO85	P17157	305 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	CNB1	P25296	175 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	HPA3	P39979	161 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	AIM36	Q03798	255 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	GIS3	Q12418	502 aa		0.74	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	COX8	P04039	78 aa		0.73	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	HAP2	P06774	265 aa		0.73	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		0.72	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	RPB7	P34087	171 aa		0.72	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	SER2	P42941	309 aa		0.72	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	0.72	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	YLR460C	P54007	376 aa		0.72	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.72	□□□□□ -2.29
SPO13	YHR014W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	PHB1	P40961	287 aa		0.71	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	PGA2	P53903	129 aa		0.71	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	LCL2	Q08045	131 aa		0.71	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		0.71	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	HTB2	P02294	131 aa		0.7	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	MRS1	P07266	363 aa		0.7	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	0.7	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	ECM4	P36156	370 aa		0.7	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	YER134C	P40081	178 aa		0.7	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	DYN3	Q04949	312 aa		0.7	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	YOL014W	Q08110	124 aa		0.7	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	YPR013C	Q12145	317 aa		0.7	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	CCW14	O13547	238 aa		0.69	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	PAM17	P36147	197 aa		0.69	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	UBC12	P52491	188 aa		0.69	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	YMR295C	Q03559	197 aa		0.69	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	BNA7	Q04066	261 aa		0.69	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	RNH1	Q04740	348 aa		0.69	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	NAT3	Q06504	195 aa		0.69	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		0.69	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	TIR1	P10863	254 aa		0.68	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	SEN2	P16658	377 aa		0.68	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	YPK2	P18961	677 aa		0.68	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	0.68	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	YNL033W	P53964	284 aa		0.68	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	YDR391C	Q04170	232 aa		0.68	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	FUS2	Q05670	677 aa		0.68	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	0.67	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	MGT1	P26188	188 aa		0.67	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	YKL102C	P34249	101 aa		0.67	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	AIM2	P39721	246 aa		0.67	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	MTW1	P39731	289 aa		0.67	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	UPS3	Q04006	179 aa		0.67	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	YOR342C	Q12182	319 aa		0.67	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		0.67	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	ARO7	P32178	256 aa		0.66	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	FMP23	P38231	175 aa		0.66	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	0.66	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	MMS2	P53152	137 aa		0.66	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	SHH3	Q04487	196 aa		0.66	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	RAD50	P12753	1312 aa		0.65	□□□□□ -2.3
SPO13	YHR014W	CBF1	P17106	351 aa		0.65	□□□□□ -2.31
SPO13	YHR014W	MRPL15	P36523	253 aa		0.65	□□□□□ -2.31
SPO13	YHR014W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	0.65	□□□□□ -2.31
SPO13	YHR014W	YNL184C	P53876	108 aa		0.65	□□□□□ -2.31
SPO13	YHR014W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	0.65	□□□□□ -2.31
SPO13	YHR014W	YMR253C	Q04835	414 aa		0.65	□□□□□ -2.31
SPO13	YHR014W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
SPO13	YHR014W	STP22	P25604	385 aa		0.64	□□□□□ -2.31
SPO13	YHR014W	SFK1	P35735	353 aa		0.64	□□□□□ -2.31
SPO13	YHR014W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	0.64	□□□□□ -2.31
SPO13	YHR014W	MET31	Q03081	177 aa		0.64	□□□□□ -2.31
SPO13	YHR014W	YPR203W	Q08994	102 aa		0.64	□□□□□ -2.31
SPO13	YHR014W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SPO13	YHR014W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SPO13	YHR014W	SNF4	P12904	322 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SPO13	YHR014W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
SPO13	YHR014W	YBR242W	P38331	238 aa		0.63	□□□□□ -2.31

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