RNA–Protein interactions for RNA: YHL003C

LAG1, Transcript of Ceramide synthase component, yeast

Gene LAG1, Length 1,236 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LAG1	YHL003C	YEL028W	P39989	153 aa		0.87	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	YFL051C	P43552	160 aa		0.87	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	HSK3	P69852	69 aa		0.87	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	YMR007W	Q03675	126 aa		0.87	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	YPR127W	Q06494	345 aa		0.87	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	YBL010C	P32788	280 aa		0.86	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	MRPL15	P36523	253 aa		0.86	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	YBR242W	P38331	238 aa		0.86	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	YLR046C	Q12253	270 aa		0.86	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.86	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	THI74	Q04083	370 aa		0.85	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	AVO2	Q04749	426 aa		0.85	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	YPR203W	Q08994	102 aa		0.85	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	MAK31	P23059	88 aa		0.84	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	VPS51	P36116	164 aa		0.84	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	FES1	P38260	290 aa		0.84	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	YHL037C	P38733	133 aa		0.84	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	FIT1	Q04433	528 aa		0.84	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	SYM1	Q06563	197 aa		0.84	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	YDL157C	Q12082	118 aa		0.84	□□□□□ -2.27
LAG1	YHL003C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		0.83	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	UBC8	P28263	218 aa		0.83	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.83	□□□□□ -2.28	not detected
LAG1	YHL003C	SLM6	P38343	150 aa		0.83	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	UIP4	Q08926	304 aa		0.83	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	YEL073C	P39974	107 aa		0.82	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	YGR269W	P40326	108 aa		0.82	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	XPT1	P47165	209 aa		0.82	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	YDR476C	Q03362	224 aa		0.82	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	LIP1	Q03579	150 aa		0.82	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	LCL2	Q08045	131 aa		0.82	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	QCR2	P07257	368 aa		0.81	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	AME1	P38313	324 aa		0.81	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	PAC10	P48363	199 aa		0.81	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	YGL193C	P53097	103 aa		0.81	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	ORM1	P53224	222 aa		0.81	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	MAK3	Q03503	176 aa		0.81	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	YML079W	Q03629	201 aa		0.81	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	YLR053C	Q12026	108 aa		0.81	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	NSL1	Q12143	216 aa		0.81	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	RDI1	Q12434	202 aa		0.81	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	NUF2	P33895	451 aa		0.8	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	DER1	P38307	211 aa		0.8	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	YGL101W	P53144	215 aa		0.8	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	TAF2	P23255	1407 aa		0.8	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		0.79	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	YAR064W	P39563	99 aa		0.79	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	CCC1	P47818	322 aa		0.79	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	YDL241W	Q07738	123 aa		0.79	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	YPR202W	Q08993	238 aa		0.79	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	ATP5	P09457	212 aa		0.78	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	PEX34	P25584	144 aa		0.78	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	FIG1	P38224	298 aa		0.78	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	GEP7	P53171	287 aa		0.78	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	YNR064C	P53750	290 aa		0.78	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	AIM36	Q03798	255 aa		0.78	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	FCY1	Q12178	158 aa		0.78	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	PET20	Q99373	253 aa		0.78	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
LAG1	YHL003C	CUP1-1	P0CX80	61 aa		0.77	□□□□□ -2.29
LAG1	YHL003C	CUP1-2	P0CX81	61 aa		0.77	□□□□□ -2.29
LAG1	YHL003C	INO4	P13902	151 aa		0.77	□□□□□ -2.29
LAG1	YHL003C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
LAG1	YHL003C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
LAG1	YHL003C	FIP1	P45976	327 aa		0.77	□□□□□ -2.29
LAG1	YHL003C	YDC1	Q02896	317 aa		0.77	□□□□□ -2.29
LAG1	YHL003C	YPR114W	Q06107	315 aa		0.77	□□□□□ -2.29
LAG1	YHL003C	CCW12	Q12127	133 aa		0.77	□□□□□ -2.29
LAG1	YHL003C	SPS2	P08459	502 aa		0.76	□□□□□ -2.29
LAG1	YHL003C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	0.76	□□□□□ -2.29
LAG1	YHL003C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
LAG1	YHL003C	APQ12	P40532	138 aa		0.76	□□□□□ -2.29
LAG1	YHL003C	CIN5	P40917	295 aa		0.76	□□□□□ -2.29
LAG1	YHL003C	DCV1	P43595	202 aa		0.76	□□□□□ -2.29
LAG1	YHL003C	YGL230C	P53074	147 aa		0.76	□□□□□ -2.29
LAG1	YHL003C	YDR102C	Q03864	110 aa		0.76	□□□□□ -2.29
LAG1	YHL003C	ATG10	Q07879	167 aa		0.76	□□□□□ -2.29
LAG1	YHL003C	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
LAG1	YHL003C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29

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