RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDI1	YER143W	IRC23	Q08416	157 aa		7.09	□□□□□ -1.27
DDI1	YER143W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		7.08	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		7.08	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		7.08	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		7.08	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		7.08	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		7.08	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		7.08	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	YPS1	P32329	569 aa		7.08	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	PTC7	P38797	343 aa		7.08	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	BNS1	P50084	137 aa		7.08	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	YML108W	Q03759	105 aa		7.08	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	RXT3	Q07458	294 aa		7.08	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		7.08	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		7.08	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	CDS1	P38221	457 aa		7.07	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	DOG2	P38773	246 aa		7.07	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	DOG1	P38774	246 aa		7.07	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	PET100	P38958	111 aa		7.07	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	DSK2	P48510	373 aa		7.07	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	ATC1	Q04005	294 aa		7.07	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	YLR122C	Q12312	125 aa		7.07	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	CDC7	P06243	507 aa		7.06	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	INO2	P26798	304 aa		7.06	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	ACP1	P32463	125 aa		7.06	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	AVT5	P38176	459 aa		7.06	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	TRS20	P38334	175 aa		7.06	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	RTS2	P40962	232 aa		7.06	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	ATG27	P46989	271 aa		7.06	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	HHO1	P53551	258 aa		7.06	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	POP5	P28005	173 aa		7.05	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	GLE2	P40066	365 aa		7.05	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	YGR219W	P53307	113 aa		7.05	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	HST4	P53688	370 aa		7.05	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	MED7	Q08278	222 aa		7.05	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	SRL1	Q08673	210 aa		7.05	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	YHR213W	P0CI67	198 aa		7.04	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	SEC59	P20048	519 aa		7.04	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	LAC1	P28496	418 aa		7.04	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	AFR1	P33304	620 aa		7.04	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	RRT1	P38192	103 aa		7.04	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	YER188W	P40103	239 aa		7.04	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	IMP2	P46972	177 aa		7.04	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	TIM21	P53220	239 aa		7.04	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	COQ3	P27680	312 aa		7.03	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	MIA40	P36046	403 aa		7.03	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	SFT2	P38166	215 aa		7.03	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	7.03	□□□□□ -1.28	not detected
DDI1	YER143W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	OCA2	P53949	197 aa		7.03	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	AYT1	Q12226	474 aa		7.03	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	YLR118C	Q12354	227 aa		7.03	□□□□□ -1.28
DDI1	YER143W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.02	□□□□□ -1.29	not detected
DDI1	YER143W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	LOA1	Q06508	300 aa		7.02	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	LDS2	Q08218	356 aa		7.02	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	FIT2	Q08906	153 aa		7.02	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	CCW14	O13547	238 aa		7.01	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	MRPL4	P36517	319 aa		7.01	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	MRPS9	P38120	278 aa		7.01	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	ICS2	P38284	255 aa		7.01	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	PGD1	P40356	397 aa		7.01	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	VMA21	P41806	77 aa		7.01	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	DAN1	P47178	298 aa		7.01	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	YNR071C	P53757	342 aa		7.01	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	SDH7	Q04401	133 aa		7.01	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	SPG4	Q04438	115 aa		7.01	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	TIM18	Q08749	192 aa		7.01	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	CYC3	P06182	269 aa		7	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	YCR041W	P37265	110 aa		7	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	MIC12	P38341	106 aa		7	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	NCE103	P53615	221 aa		7	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	HMX1	P32339	317 aa		6.99	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	SDH4	P37298	181 aa		6.99	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	CYB5	P40312	120 aa		6.99	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	PAU15	P40585	124 aa		6.99	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	GPI2	P46961	280 aa		6.99	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	VPS55	P47111	140 aa		6.99	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	CPD1	P53314	239 aa		6.99	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	STP4	Q07351	490 aa		6.99	□□□□□ -1.29
DDI1	YER143W	NNK1	P36003	928 aa		6.98	□□□□□ -1.29

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.2 ms